mirDNMR
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Wenzhou Medical University |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | 遺伝子中心のバックグラウンド 新生突然変異率（DNMR ： novo mutation rate） のデータベースです。異なる方法および集団の変動データから得られたバックグラウンドDNMRや各遺伝子のヒト遺伝子変異データベースにおける変異アレル頻度を収録しています。データベースには次の機能があります。(i) 次の 4 つの方法によって予測された各遺伝子のバックグラウンドDNMRをブラウズし、検索する：GC コンテンツ（DNMR-GC）、配列コンテキスト（DNMR-SC）、遺伝子の長さ、変異タイプ、生物学的進化などの複数因子（DNMR-MF）および局所的 DNA メチル化レベル（DNMR-DM）、 （ii）ExAC、ESP6500、UK10K、1000G、 dbSNP などの公開されているデータベースの変異頻度を検索する、（iii）3つの統計的方法（TADA、二項検定、ポアソン検定）を用いて、4 種のバックグラウンド DNMR に基づいて候補遺伝子に優先順位を付けるための DNM 負荷を調べる、 （iv）バックグラウンドDNMRに基づく遺伝子リストのフィルタリング、およびヒトの遺伝子変異データベースにおける様々なタイプの変異体の分布、（v）知的障害および制御のための背景遺伝子ベースのDNMR（DNMR-GC、DNMR-SC、DNMR-MF、DNMR-DM、DNMR-平均）およびトリマーベースのWES / WGSからの制御をダウンロードします。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.68f4xz |
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類似データベース:
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Digenic diseases database DBH2H Chickpea Portal TIARA MutDB CADD dbDNV Tree Shrew Database iDog Mouse Phenome Database |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |