CADD: Combined Annotation-Dependent Depletion
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| 運用機関名: | University of Washington |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | ヒトゲノムの一塩基バリエーションおよび挿入／欠損による有害性をスコア化するCombined Annotation-Dependent Depletion (CADD)のためのサイトです。CADDはバリアントに様々なアノテーションを統合して客観的な重み付けをします。染色体位置と使用するリファレンスを指定すると、スコアと、変異塩基、転写に関するアノテーションタイプ（コード、ノンコード、モチーフなど）、GC率、CpG、GeneIDなどが一覧で表示されます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, 個体/種, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://cadd.gs.washington.edu/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://cadd.gs.washington.edu/download |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://cadd.gs.washington.edu/contact |
| API / SPARQL endpoint: | https://cadd.gs.washington.edu/api |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Type 2 Diabetes Knowledge Portal iJGVD Immuno-Polymorphism Database TogoVar BGD iDog euL1db, the European database of L1-HS retrotransposon insertions in humans DBASS DistiLD Database: Diseases and Traits in Linkage Disequilibrium Blocks Mediterranean Founder Mutation Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-05-12 |
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レコード最終更新日:
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2020-05-12 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |