運用終了
iJGVD: Integrative Japanese Genome Variation Database
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| 運用機関名: | 東北大学東北メディカル・メガバンク機構 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 日本人健常者のゲノム配列を解析したデータベースです。東北メディカルメガバンクの行うゲノムコホート調査に参加した日本人の全ゲノム解析より得られた1塩基バリエーション (SNV) とその頻度を収録しています。重複、欠失の情報も収録しています。データはゲノムブラウザによってリファレンス配列とともに表示されます。また、遺伝子名、dbSNP rsID、染色体位置による検索が可能です。 なお、SNVの頻度情報一覧はNBDCヒトデータベース (http://humandbs.biosciencedbc.jp/hum0015-v1) よりダウンロードできます。 2019年9月、iJGVDのデータはJRGのデータと共にjMorp （https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01518 ）に移行されました。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://jmorp.megabank.tohoku.ac.jp/201909/downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://jmorp.megabank.tohoku.ac.jp/201909/help/conditions-of-use |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TogoVar JSNP（アーカイブ） gnomAD Cancer Genome Mine VDJbase DistiLD Database: Diseases and Traits in Linkage Disequilibrium Blocks DBASS 統合がんゲノムデータベース iDog Mutation Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2015-10-27 |
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レコード最終更新日:
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2021-05-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |