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Pocketome: an encyclopedia of small-molecule binding sites in 4D: Pocketome
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| 運用機関名: | The Abagyan Lab UC San Diego, University of California San Diego |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 低分子化合物により機能調節ができる可能性が高い結合部位（druggable binding site）の立体構造的な組み合わせに関する百科事典です。立体構造は、Protein Data Bank に収載された共結晶構造から、実験的に特定することができます。各エントリーは、低分子およびペプチドとの一時的な相互作用に関与するタンパク質表面上の部位を表わし、結合サイトの構造、ポケットの位置、結合部位の位置、ポケットとリガンドの立体的互換性やタンパク質の３次元表示を含んでいます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質, 薬 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ, 配列, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
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| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.tc6df8 |
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類似データベース:
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BindingDB database of measured binding affinities Protein-ligand affinity change upon mutation dbAMP TargetMine VnD PSCDB 3D interacting domains PiSITE PreDom DB-SPIRE（アーカイブ） |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |