Echinobase
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Center for Computational Regulatory Genomics, Beckman Institute |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 棘皮動物群の比較ゲノムプラットフォームを中心とする統合データベースです。ムラサキウニ、エゾヒトデ、オニヒトデのゲノム情報と、それらや他の棘皮動物の遺伝子、発現情報に加え、形態や発生に関するオントロジー情報も収録しています。遺伝子やトランスクリプトームによる検索、JBrowseによるゲノムブラウズ、Blast検索、BAC TableによるBAC NCBI へのリンクが利用可能です。 EchinoBase（http://legacy.echinobase.org/Echinobase/ で稼動中）、およびその前サイトであるSpBase (http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00686) の後継サイトです。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, オントロジー/用語/命名法 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://www.echinobase.org/other/static-echinobase/ftpDatafiles.jsp |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://www.echinobase.org/other/static-echinobase/aboutMOD.jsp |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://www.echinobase.org/other/static-echinobase/contactUs.jsp |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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AgBase LegumeIP SpBase Banana Genome Hub Genome Database for Rosaceae TrichDB Toxoplasma Genomics Resource IMORI TriTrypDB PlasmoDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2015-06-30 |
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レコード最終更新日:
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2020-10-04 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |