運用終了
AgBase
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | AgBase, Mississippi State University |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 農作物や動物の遺伝子について遺伝子オントロジーを含めた構造アノテーションや機能アノテーションを行うデータベースです。データ収集元のDB名とアクセス番号、タンパク質名、遺伝子名、得られた生物種名、アミノ酸配列が収録されています。またInterPro、Pfam、UniParc、Embl/GenBankやGOへのリンクもあります。生物種、GO IDなどによる絞り込みが可能です。 オリジナルのAgBaseは運用を終了し、Host Pathogen Interaction Database （https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc02033 ）に統合されています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, オントロジー/用語/命名法 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.kn4ycg |
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類似データベース:
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Echinobase Banana Genome Hub Eukaryotic Genes Ancestral Genomes MarpolBase LegumeIP Fungal Nomenclature and Species Bank DAGViz Coli Genetic Stock Center Aspergillus Genomes |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2022-09-29 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |