運用終了
TOT-DB: The Theileria orientalis Genome Annotation Database
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| 運用機関名: | 北海道大学 人獣共通感染症リサーチセンター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 寄生性原虫Theileria orientalisの全ゲノムを対象にしたデータベースです。G-integraプラットフォームのゲノムブラウザによって、発現データおよび遺伝子予測ソフトウェアからアノテーションされた遺伝子領域が表示されます。 病原性の強いT. parvaやT. annulataとのゲノム比較ができます。またゲノムブラウザ上で閲覧するだけではなく、BLASTによる相同性検索やデータの一括ダウンロードも行えます。全ゲノムの配列はホールゲノムショットガンと手動のギャップクロージング、自動および手動のアノテーションとを組み合わせて決定されています。 |
| 生物種: | , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://totdb.czc.hokudai.ac.jp/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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http://medals.jp/list/detail/189.html |
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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HGD GENCODE DAIZUbase Medaka Methylome Browser KAIKObase SoybeanTFDB EnsemblProtists BGDB EnsemblPlants EnsemblFungi |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2013-07-29 |
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レコード最終更新日:
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2019-05-16 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
