PMN: Plant Metabolic Network
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| 運用機関名: | Carnegie Institution for Science/Department of Plant Biology |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | PMNは生化学者とデータベースのコラボレーションプロジェクトであり、植物の代謝パスウエイデータベースを構築することを目標としています。 PMNで現在公開しているデータベースは、「PlantCyc」「AraCyc」「PoplarCyc」および他の植物代謝データベースのリンク集です。 「PlantCyc」はPMNの中心的存在となる包括的な植物生化学パスウエイデータベースであり、300種類以上の植物の一次代謝、二次代謝に関わる遺伝子、酵素、化合物、反応、パスウエイについての文献情報やコンピュータによる解析結果をキュレートし提供しています。 「AraCyc」はモデル植物であるシロイヌナズナの代謝パスウエイに関する情報をキュレートし提供しています。シロイヌナズナの実験データ（遺伝子発現データ、プロテオミクスデータ、メタボロミクスデータ）を代謝パスウエイマップに重ねることができます。 「PoplarCyc」はモデル樹木であるポプラとその近縁種やハイブリッド種の代謝パスウエイに関する情報をキュレートし提供しています。ポプラの実験データ（遺伝子発現データ、プロテオミクスデータ、メタボロミクスデータ）を代謝パスウエイマップに重ねることができます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | RNA, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.plantcyc.org/downloads/data_downloads.faces |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://www.plantcyc.org/downloads/data_downloads.faces |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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DBGET Search - RPAIR MetaCyc KEGG LIGAND Database PINT BioCyc RNAct DBGET Search - ENZYME Networks of Functional Coupling of proteins The Comprehensive Enzyme Information System (BRENDA) KEGG REACTION |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2012-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |