DB-SPIRE（アーカイブ）: Database for Structure-based Protein Interaction Research
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 実験的または配列解析（ホモロジー検索とマルチプルアライメント）によって同定されたアミノ酸配列モチーフのタンパク質立体構造における位置を収録しています。アミノ酸配列モチーフデータベースとしてPROSITEとBLOCKSの2種類を用い、タンパク質立体構造データベースとしてProtein Data Bank (PDB)を用いています。 産業技術総合研究所によるオリジナルサイト（http:// mbs.cbrc.jp/DB-SPIRE/ ）の運用は終了しました。DB-SPIREのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブからご利用いただけます。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/dbspire/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/dbspire/LATEST/README.html |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/dbspire/lic.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/dbspire/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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http://medals.jp/list/detail/50.html |
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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ConfC （アーカイブ） GENIUS II（アーカイブ） SAHG （アーカイブ） PDBSTR Protein Quaternary Structure eF-site GTOP イネタンパク質構造データベース（アーカイブ） GTOP (Rice version) OLIGAMI |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2022-01-13 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
