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CyanoClust database: Database of homologous proteins in cyanobacteria and plastids
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| 名称: | |
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| 運用機関名: | 東京大学 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 原核、真核両ドメインにまたがる広汎なタンパク質についての高品質な自動クラスタリングを行うソフトウェア「GCLUST」を用いて、10種のバクテリアと38種のシアノバクテリア、59種の葉緑体、1種類の有殻アメーバの全タンパク質のクラスタリングを行い、その結果を収録したデータベースです。系統プロファイリングによる検索が可能なことが特徴です。さらに、植物プロモータデータベースPPDBとの連携により、相同タンパク質のプロモータ構造を比較することができます。 |
| 生物種: | , , |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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SALAD Database InterPro HAMAP database of microbial protein families PlantsT PROSITE MnM ECRbase Gclust Server Protein Cluster PANDIT |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2018-03-18 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
