RAP-DB: Rice Annotation Project DataBase
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | イネアノテーションプロジェクト（RAP）によるイネゲノムの高精度注釈（アノテーション）情報を収録したデータベースです。論文からのマニュアルキュレーションによりアノテーション情報を追加しています。ゲノムブラウザ（GBrowse/JBrowse）により、アノテーション情報をグラフィカルに参照できます。また、ユーザー自身の配列とイネゲノム配列の類似性検索（BLAST/BLAT）を行うことができます。さらに、ゲノムブラウザTASUKE+により、500品種以上のイネのゲノムワイドな多型情報を閲覧することができます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://rapdb.dna.affrc.go.jp/download/irgsp1.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://rapdb.dna.affrc.go.jp/download/irgsp1.html |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://rapdb.dna.affrc.go.jp/contact.html |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Xanthobase TOT-DB Mycoplasma penetrans Genome CCDS Escherichia coli strain K12 genome database DeinoBase KEGG GENES Database SubtiList World-Wide Web Server mycoCLAP Buruli ulcer bacillus Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2020-11-23 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
