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Annotated regulatory Binding Sites from Orthologous Promoters: ABS

運用機関: Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM), SBI

説明: プロモーターや遺伝子についての情報を伴うオーソロガスな結合サイトの... 詳細へ

運用機関: Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire (IGBMC), Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM)

説明: 反復配列、膜貫通配列、および循環配列のための機能拡張を含むベンチマ... 詳細へ

休止
(14日以上)

Protein Classification Benchmark Collection

運用機関: International Centre Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB), Jedlik Laboratories: Bioinformatics, Faculty of Information Technology, Pázmány Péter Catholic University

説明: 機械学習法の性能比較が可能な標準データセットを作成するためのコレク... 詳細へ

休止
(14日以上)

European Hepatitis C Virus database: euHCVdb

運用機関: National Centre for Scientific Research (CNRS), Institut de Biologie et Chimie des Proteines (IBCP), Centre National de la Recherche Scientifique, Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM)

説明: C型肝炎ウイルスのタンパク質配列、構造および機能解析、ならびに構造生... 詳細へ

SABIO-RK Biochemical Reaction Kinetics Database: SABIO-RK

運用機関: FAIRDOM, Heidelberg Institute for Theoretical Studies (HITS)

説明: 生化学反応、この反応の運動方程式およびパラメータ、ならびにこれらの... 詳細へ

休止
(2日目)

Health Canada Drug Product Database: HC DPD

運用機関: Health Canada

説明: カナダでの使用が承認された医薬品に関する製品固有の情報を収録したデ... 詳細へ

運用終了

The Gene Index Project: TIGR_TGI

運用機関: Harvard University, Dana-Farber Cancer Institute

説明: 入手可能な EST および遺伝子配列を、可能な限り参照ゲノムと一緒に使用... 詳細へ

Human Oral Microbiome Database: eHOMD

運用機関: Forsyth Institute

説明: ヒトの口腔内に存在する原核生物種に関する、部位特異的な包括的データ... 詳細へ

TriTrypDB

運用機関: Computational Biology and Informatics Laboratory (CBIL), University of Pennsylvania, Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia, The Wellcome Trust Sanger Institute, The Wellcome Trust Genome Campus

説明: トリパノソーマ科（Leishmania 属、Trypanosoma 属）の統合ゲノムデータ... 詳細へ

TrichDB

運用機関: Computational Biology and Informatics Laboratory (CBIL), University of Pennsylvania, Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia

説明: 腟トリコモナスの統合ゲノムデータベースです（EuPathDBのファミリーデ... 詳細へ

ToxoDB

運用機関: Bioinformatics Resource Centers, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), National Institutes of Health (NIH)

説明: ヒトおよび動物の疾病（トキソプラズマ症を含む）を引き起こす単細胞真... 詳細へ

PlasmoDB

運用機関:

説明: ヒトおよび動物の疾病（マラリアを含む）を引き起こす単細胞真核生物病... 詳細へ

GiardiaDB

運用機関:

説明: ヒトの下痢性疾患の原因となるランブル鞭毛虫のゲノムと機能をまとめた... 詳細へ

Eukaryotic Pathogen, Vector and Host Informatics Resource: VEuPathDB

運用機関: Institute of Integrative Biology, University of Liverpool, The Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology, The Wellcome Trust Sanger Institute, Bioinformatics Resource Centers, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), National Institutes of Health (NIH)

説明: 真核生物病原体をカバーする統合ゲノムデータベースです。同じ構造で構... 詳細へ

CryptoDB

運用機関: Computational Biology and Informatics Laboratory (CBIL), University of Pennsylvania, Center for Tropical & Emerging Global Diseases, University of Georgia

説明: 寄生虫クリプトスポリジウムのゲノムと機能をまとめた統合的ゲノムデー... 詳細へ

休止
(5日目)

STING

運用機関: Computational Biology Research Group , Embrapa/Informatica Agropecuaria

説明: タンパク質と他の生体巨大分子との相互作用に関する情報を収録したデー... 詳細へ

Side Effect Resource: SIDER

運用機関:

説明: 市販されている医薬品およびその記録された副作用に関する情報を収録し... 詳細へ

休止
(14日以上)

Escherichia coli strain K12 genome database: EcoGene

運用機関:

説明: 大腸菌 K-12 ゲノムおよびプロテオーム配列に関する最新情報を含むデー... 詳細へ

HUGO Gene Nomenclature Committee: HGNC

運用機関: Human Genome Organisation (HUGO), Transforming Genetic Medicine Initiative

説明: HGNCデータベースは、HGNC (HUGO Gene Nomenclature Comittee) が既知の... 詳細へ

The European Genome-phenome Archive: EGA

運用機関: Comparative Genomics Group (CRG), ELIXIR-Hub, MRC Laboratory of Molecular Biology (LMB), European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)

説明: さまざまなデータ提供者から提供されたゲノム研究のデータセットを探索... 詳細へ

Chemical Component Dictionary: CCD

運用機関: European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), wwPDB, European Molecular Biology Laboratory (EMBL)

説明: Protein Data Bank のエントリーに含まれるすべての残基および小分子成... 詳細へ

figshare

運用機関: Digital Science, Macmillan Publishers, Datacite

説明: ユーザーの研究者が、自らの研究成果のすべてを、引用、共有、発見が可... 詳細へ

PhylomeDB

運用機関: Comparative Genomics Group (CRG)

説明: 遺伝子系統（phylomes）のカタログデータベースです。遺伝子の履歴を、... 詳細へ

The Diatom EST Database

運用機関: Laboratoire de Microbiologie et Genetique Moleculaires (LMGM)

説明: 珪藻生物学の研究に利用することができる珪藻のEST（発現配列タグ）デー... 詳細へ

The Carbohydrate-Active enZYmes Database: CAZy

運用機関: Laboratoire Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques (AFMB), Université d'Aix-Marseille

説明: グリコシド結合を分解、改変、または生成する酵素について構造的に関連... 詳細へ

休止
(14日以上)

FireDB

運用機関:

説明: Protein Data Bank (PDB) の構造、リガンド、およびアノテーションが付... 詳細へ

Oryza Tag Line: OTL

運用機関: Bioversity International

説明: Genoplante プロジェクトによるイネ挿入変異株ライブラリーの評価から得... 詳細へ

GreenPhylDB: A phylogenomic database for plant comparative genomics: GreenPhyl

運用機関: International Cooperation Center for Agricultural Research for Development (CIRAD), Bioversity International, Generation Challenge Programme, South Green

説明: 主要な植物門の進化に関する 37 種の完全ゲノムを含むデータベースです... 詳細へ