統合がんゲノムデータポータル
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | 公益財団法人がん研究会がん研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | がんゲノム研究で集積されたゲノム、トランスクリプトーム、miRNAなどの研究プロジェクトに関する情報を整理したデータベースです。研究プロジェクトの概要、検体の解析方法、患者から提供された検体の属性（正常、腫瘍、性別、年代など）、臨床情報などを収録しています。ゲノムデータは、NBDCヒトデータベース （https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01348 ） に登録されており、アクセション番号と検体の属性情報とを掲載しています。また、トランスクリプトームおよびmiRNAデータは、NCBIのGEO （Gene Expression Omnibus）にも登録されています。がん種やデータの種類（WGS、WES 、mRNAトランスクリプトーム、miRNAトランスクリプトーム、アレイ 、RNA-seq 、RT-PCR）による絞り込みが可能です。 統合がんゲノムデータベース （https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00760 ）の改訂版です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | 健康/疾患, ゲノム/遺伝子, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 書誌/ドキュメント, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 日本語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://genomeportal.jfcr.or.jp |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
EVmiRNA BioXpress ChimerDB DBKERO mirEX 日本人難聴遺伝子データベース D3G microRNA.org PmiREN ICGC Data Portal |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2020-01-14 |
|
レコード最終更新日:
|
2020-01-14 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |