データベースのレコード一覧

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運用機関: 岡山県農林水産部農産課
生物種: Tracheophyta | Equisetaceae | Zygnemataceae |
説明: 水田や畑に生息する雑草のデータベースです。雑草の学名、俗称、発生場所や生息状況の説明および写真を収録しています。発生場所やキーワードによる検索が可能です。 詳細へ
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運用機関: 岡山県農林水産部農産課
生物種: Magnoliophyta | Arthropoda | Viruses | Fungi |   
説明: 作物につく病害虫のデータベースです。病害または病害虫の一般名称、学術名称、罹患作物名、被害と見分け方、予防方法および症状の写真を収録しています。作物名や病害虫の発生部位、キーワ... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
説明: 植物の代謝物を分布様式、生物活性ごとに分類し、代謝物、代謝物質の生態学的活性とその対象生物という関係を検索できるデータベースです。代謝物名、代謝物が存在する生物・組織、カテゴリ... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
説明: 食材が持つ効能 (性味,帰経など) と薬膳レシピのデータベースです。食材の効能検索では、効能の他、含有成分、標準成分表、アミノ酸組成表が収録されています。また食材、効能、体質九分類か... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Glycine max | Solanum lycopersicum | Raphanus sativus | Capsicum | Fragaria x ananassa | ...
説明: 作物ゲノム育種研究センターによる作物ゲノム関連データベースのリンク集です。作物全体、ダイズ、ムギ類、果樹類、野菜類、飼料作物類、花き類に関するデータベースが収録(一部今後収録予... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa
説明: 作物ゲノム育種研究センターによるイネゲノム関連データベースのリンク集です。品種特性や実験材料に関するデータベースも紹介されています。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: cattle | deer | horse | sheep | pig | ...
説明: 家畜疾病の特徴と対策をまとめたデータベースです。ウシ、ウマ、めん羊、ヤギ、豚・イノシシ、家禽の疾病について、罹患動物の種類、特徴と対策が収録されています。法定伝染病や届出伝染病... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa
説明: 農研機構作物研究所から配布可能なイネ遺伝解析材料 (染色体断片導入系統群)の情報を収めたサイトです。コシヒカリ*5/O.rufipogon および いただき*5/O.glumaepatula によって作成された染... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa | Triticum aestivum | Hordeum vulgare | Glycine max | Ipomoea batatas
説明: 農研機構が作製、保管する育成系統 (品種登録前の品種候補) の一覧です。水稲、小麦、大麦、大豆について、系統名、系統育成年、主要特性や栽培適地の情報を収録しています。それぞれの品種... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa | Triticum aestivum | Hordeum vulgare | Glycine max | Ipomoea batatas | ...
説明: 農研機構作物研究所が育成した作物新品種の一覧です。イネ、小麦、大麦、大豆、かんしょ、アマランサス、ごまの新品種について、品種名、品種登録年月、交配組み合わせと品種の特性が収録さ... 詳細へ
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運用機関: 環境省自然環境局 生物多様性センター
生物種:
説明: 生物多様性データを統合的に共有化する目的で、全国の生物情報を集積、共有、提供しているシステムです。観察された生物の確認年月日と場所、和名、学名、写真、報告者が登録されています。... 詳細へ
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運用機関: Howard Hughes Medical Institute
生物種:
説明: タンパク質ファミリーに関する物理的相互作用のデータベースです。Protein DataBank(PDB)から抽出した既知タンパク質構造から計算されたタンパク質ドメイン間の相互作用、リガンドとの相互... 詳細へ
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運用機関: EMBL-EBI
生物種: Metazoa | Ascomycota | Codonosigidae | Arabidopsis thaliana |
説明: 動物のゲノムから推測される遺伝子の系統関係のデータベースです。種々の動物ゲノムの配列情報を用いて、オーソログやパラログについての信頼できるキュレーションされた情報を提供すること... 詳細へ
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運用機関: University of Montana
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Danio rerio | Nematoda | Drosophila
説明: 完全長の真核生物ゲノムにおける反復DNA配列の配列アライメント、隠れマルコフモデル、適合リストのコレクションです。配列の説明、記載文献、分類、モデルとdfam配列間での一致度などを収録... 詳細へ
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運用機関: jPOSTプロジェクト
生物種:
説明: 本DBは、国内外に散在している種々のプロテオーム情報を標準化・統合・一元管理し、データベース化したもので、多彩な生物種の翻訳後修飾や絶対発現量等 の情報まで網羅したプロテオーム統合... 詳細へ
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運用機関: 名古屋大学 トランスフォーマティブ生命分子研究所
生物種: Torenia
説明: トレニアゲノムプロジェクトで明らかとなったトレニア (Torenia; ツルウリクサ属) のゲノムや遺伝子の塩基配列などを提供するデータベースです。cDNA塩基配列、ORF、遺伝子発現領域、シロ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人海洋研究開発機構 地球環境観測研究開発センター
生物種: Foraminifera
説明: 世界の海洋に生息する単細胞の原生動物プランクトン「浮遊性有孔虫」のデータベースです。種の分類や殻、口孔、棘状突起などの形態的特徴の解説に加えて光学顕微鏡画像、電子顕微鏡(SEM)画... 詳細へ
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運用機関: ORFeome Collaboration
生物種: Homo sapiens
説明: 国際共同研究グループ The international ORFeome Collaboration (OC) が提供する完全長で精度の高いヒトのORFクローンのデータベースです。29,597クローンで、RefSeq や Ensembl に収録され... 詳細へ
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運用機関: カビアレルゲンデータベース
生物種: Aspergillus luchuensis | Aspergillus kawachii | Aspergillus niger CBS 513.88 | Aspergillus niger ATCC 1015
説明: カビ(真菌)のアレルゲン情報のデータベースです。IUIS Allergen database (http://www.allergen.org) から真菌類のデータを抽出し、4種類の菌 (黒麹菌、白麹菌、A. niger CBS、A. nige... 詳細へ
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運用機関: University of Leipzig, University of Strasbourg
生物種: Eumetazoa | Placozoa | Porifera
説明: ミトコンドリアtRNA遺伝子のデータベースです。約1500種の全シークエンスされた後生動物のミトコンドリアRefSeqゲノムのうち3つ組アンチコドンのアミノ酸選択性により分類された30,000以上の... 詳細へ
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運用機関: Shujiro Okuda laboratory
生物種: Bacteria | Archaea
説明: 人体と地球上の環境に生息する微生物と微生物層についてのゲノムとバーチャルメタゲノム(微生物コミュニティーにおける16S rRNAsから再構成したもの)のデータベースです。公共のデータベー... 詳細へ
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運用機関: Screening Committee of Anticancer Drugs (SCADS)
生物種: Homo sapiens
説明: 化合物の制がん作用と関連する遺伝子発現変化の情報を提供するデータベースです。5種類のヒトがん細胞株(結腸がん HT-29,卵巣がん SKOV3,白血病 K562,肺がん H2228,肺がん PC-9)をさま... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明: 理化学研究所の天然化合物バンク (RIKEN NPdepo) に登録されている化合物を検索するデータベースです。化合物の名称、CAS番号、分子量、構造、InChI情報等を収録しています。生理活性やスペ... 詳細へ
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運用機関: Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC)
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans
説明: マイクロRNAターゲット予測と発現プロファイルの包括的なデータベースです。ターゲット予測はmiRandaアルゴリズムの発展によって、発現プロファイルは哺乳類の組織や正常および疾病由来の細... 詳細へ
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運用機関: Nigel Collier
生物種:
説明: Web 上のニュース記事を利用した感染症監視システム(BioCaster)で使用する目的で作成された、感染症に関するオントロジーです。病原体、症状、感染経路、宿主生物に関して、概念の定義と概... 詳細へ
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運用機関: 京都大学 iPS細胞研究所
生物種: Homo sapiens
説明: 京都大学iPS細胞研究所 (CiRA) の研究活動を紹介するサイトです。「研究材料の提供」ページでは、提供可能なヒトやマウスのiPS細胞や疾患特異的iPS細胞、マウスのES細胞やDNA試料等がリスト... 詳細へ
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運用機関: Dana-Farber Cancer Institute
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus
説明: 公開された文献から手動でキュレートした遺伝子シグニチャー (遺伝子発現解析結果からの変動遺伝子群) のデータベースです。主にがん、幹細胞、免疫細胞、発生、肺疾患に関連する遺伝子発... 詳細へ
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運用機関: 慶應義塾大学
生物種: Dugesia japonica
説明: プラナリアESTのデータベースです。独自に開発したプラナリア無性生殖個体を有性生殖個体に転換させる系(有性化)を用いて、有性化個体からcDNAライブラリを作成しました。ESTおよびクラスタ... 詳細へ
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運用機関: Yale University School of Medicine
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトの脳に関するトランスクリプトームデータのデータベースです。死亡後の脳の両半球から得られる組織サンプルをAffymetrix GeneChip Human Exon 1.0ST Arraysを使って解析した、ゲノム全体... 詳細へ
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運用機関: ライフサイエンス出版株式会社
生物種: Homo sapiens
説明: 循環器疾患を対象とした、主要な大規模臨床試験,疫学研究を収録するデータベースです。主要ジャーナルに論文掲載されたトライアルに、循環器関連の主要学会において発表されたものを追加し... 詳細へ
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運用機関: International Cancer Genome Consortium (ICGC)
生物種: Homo sapiens
説明: 国際がんゲノムコンソーシアム (ICGC) に登録、公開されているがんのゲノム変異の研究データを、可視化、検索、ダウンロードするためのサイトです。日本からも国立がん研究センター等、大学... 詳細へ
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運用機関: 明治大学
生物種: Arabidopsis thaliana | Oryza sativa | Solanum lycopersicum | Sorghum bicolor | Vitis vinifera | ...
説明: 高速シーケンサーにより得られた遺伝子発現プロファイルデータをもとに、文献情報に基づく知識情報を組み合わせた遺伝子発現ネットワーク情報を提供するデータベースです。種々の植物の遺伝... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人森林総合研究所
生物種: Lentinula edodes
説明: シイタケ栽培品種の育成者権の保護強化のため、効率良く品種判別する方法を開発しました。日本の栽培シイタケ 133品種と野生菌株21菌株を特定するIGS1-DNA情報をDDBJ/EMBL/Genbank上で公開し... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人森林総合研究所
生物種: Prunus
説明: 多摩森林科学園サクラ保存林に収集しているサクラに関するデータベースです。各サクラの履歴情報や花の形態測定データ、写真、遺伝子型、幼果菌核病罹病リスクなどの情報が紹介されています... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人国際農林水産業研究センター
生物種: Chlorophyta | Phaeophyceae | Rhodophyta | Characeae | Tracheophyta
説明: タイ沿岸の水中植物のウェブ写真図鑑です。緑藻、褐藻、紅藻、車軸藻、海草の写真と採集地、水深、植物の特徴と生息場所の説明が収録されています。 このデータベースはタイのカセサート大学... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人国際農林水産業研究センター
生物種: Bacteria | Fungi |
説明: タイの発酵食品を原料ごとに分類し、写真と共に解説したデータベースです。発酵食品に使用された生物種名、発酵食品に含まれる微生物種の学名が掲載されています。 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
生物種: Marchantia polymorpha
説明: ゼニゴケの完全長ゲノム配列の予備的なゲノム情報データベースです。ゲノムブラウザ、BLAST検索、塩基配列やタンパク質のデータをデータベースへ登録する機能、および遺伝子の名称を組織的に... 詳細へ
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運用機関: 東京大学総合研究博物館
生物種:
説明: 東京大学総合研究博物館が収蔵する動物と昆虫に関する標本のデータベースです。登録番号と種名、採取地などの情報が収録されています。 詳細へ
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運用機関: 東京大学総合研究博物館
生物種:
説明: 東京大学総合研究博物館が収蔵する古生物資料のデータベースです。標本データベースには標本の写真と学名、文献の情報が収録されており、学名、標本番号、標本生物の棲息時代などから検索で... 詳細へ
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運用機関: 神戸大学
生物種:
説明: PubChemとChEBIから情報を取得したアミノ酸とケト酸様化合物について、計算により適切な合成系を推定したデータベースです。アミノ酸とケト酸様化合物の構造、組成、分子量と予測される代謝... 詳細へ
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運用機関: ViBrism Database Committee
生物種: Mus musculus
説明: オリジナルのマッピング法によって遺伝子発現トモグラフィーを作成したマウス脳の遺伝子発現3Dマップです。第8週のオスの脳について、36, 558の発現マップを検索できます。また、遺伝子発現... 詳細へ
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運用機関: DNAバーコードデータベース作成委員会
生物種: Gastropoda | Bivalvia | Squamata | Hirudinea | Elateridae | ...
説明: DNAバーコーディングで用いられる塩基配列と証拠標本のデータベースです。日本国内で進行する複数のDNAバーコーディングプロジェクトにおいて用いられる、証拠標本の画像を含む情報とDNA塩基... 詳細へ
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運用機関: 厚生労働省
生物種: Homo sapiens
説明: 指定難病の概要、症状、治療法、診断基準等の情報を難病別に閲覧できます。臨床調査個人票のダウンロードもできます。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明: 「話題の食品・食品成分」は、「特定保健用食品」「ビタミン」「ミネラル」等についての情報を提供しています。「特定保健用食品」では、特定の保健機能が国によって確認され、認可を受けた... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明: いわゆる「健康食品」を原因とする、国内外における過去ならびに最新の健康危害の事例を紹介します。成分名や製品名、注意喚起や勧告を出した機関名等を検索欄に入れ、関連情報を絞り込むこ... 詳細へ
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運用機関: 明​治​大​学​ ​農​学​部
生物種: Solanum lycopersicum
説明: トマトの統合オミックスデータベースです。全てのトマトのEST配列、マイクロトムの完全長cDNA配列、ITAG2.4遺伝子モデルの配列を収録しています。各配列は予測されたゲノム上の位置に基づい... 詳細へ
運用機関: 東京大学 大気海洋研究所
生物種: Copepoda | Appendicularia | Mysidacea | Chaetognatha
説明: CMarZ (Census of Marine Zooplankton)が提供する動物プランクトンに関する情報の統合検索システムです。プランクトンの写真、スケッチ、文献の情報や生息分布図、採集地などの情報、解析... 詳細へ
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運用機関: 北海道大学
生物種: Synechocystis sp. PCC 6803 | Arabidopsis thaliana
説明: 光合成を行う生物のためのタンパク質複合体解析のデータベースです。シロイヌナズナのチラコイドとSynechocystis PCC6803の細胞全体のタンパク質複合体について、Blue-Native PAGE後に切り出... 詳細へ
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運用機関: 株式会社情報数理バイオ, 明治大学
生物種: Bos taurus | Mus musculus | Homo sapiens
説明: ヒト、ウシ、マウスのゲノムから新規GPIアンカー型タンパク質の遺伝子を予測した結果のデータベースです。N末端、C末端からの30残基以内の平均疎水性値、C末端から30残基以内で最も平均疎水... 詳細へ
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運用機関: 九州大学 大学院医学研究院, 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans | Saccharomyces cerevisiae
説明: 論文などで報告された ChIP-seq データの可視化と解析を行うサイトです。公開 NGS データレポジトリ (NCBI, EMBL-EBI, DDBJ) に登録されたほぼ全ての ChIP-seq データをデータソースとしてい... 詳細へ