データベースのレコード一覧

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運用機関: 東京大学 総合研究博物館
生物種: Moniliformopses
説明: 東京大学植物標本室に収蔵されているネパール産維管束植物標本のうちシダ植物の情報を公開しています。採取場所に関する位置情報、画像データ等が掲載されています。学名や地名、採集情報に... 詳細へ
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運用機関: 厚生労働省
生物種: Homo sapiens
説明: 「レセプト情報・特定健診等情報データベース(以下NDB)」に蓄積されたレセプト情報及び特定健診情報を抽出し、集計データとして公表するサイトです。全国のレセプト内容を整理した算定情報... 詳細へ
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運用機関: 愛媛大学
生物種:
説明: 環境内、特に生物中の化学物質濃度情報を収集したデータベースです。論文や公的機関によるレポートによる情報を統一された書式で登録しています。各データセットには実験方法に関する情報(... 詳細へ
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運用機関: 山梨大学大学院医学工学総合研究部
生物種: Homo sapiens
説明: 母子保健・医療に関する情報を、政府の基本統計や各種報告書等を元にまとめたデータベースです。主に調査研究を行っている報告書等を対象として情報収集しています。文献の書誌情報と共に、... 詳細へ
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運用機関: Department of Molecular Genetics, University of Toronto
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans |
説明: RNA結合タンパク質のデータベースです。手作業によってキュレーションされたRNA結合タンパク質はRNA結合ドメインごと、または生物種ごとに分類されています。遺伝子名あるいは核酸配列による... 詳細へ
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運用機関: University of Delaware, Georgetown University Medical Center
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Escherichia coli
説明: タンパク質のオントロジーのデータベースです。現段階ではヒト、マウス、大腸菌のタンパク質アイソフォーム、変異体、および修飾体と、それらの複合体に関する統合的な情報を、階層構造状に... 詳細へ
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運用機関: 独立行政法人 製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター
生物種: Saccharomyces cerevisiae
説明: 製品評価技術基盤機構バイオテクノロジーセンターが保有する酵母の電子顕微鏡画像のデータベースです。3種の形状(細胞、菌糸、胞子)画像と、撮影時の培地条件に関するデータを収録していま... 詳細へ
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運用機関: Department of Computational and Data Science, Indian Institute of Science
生物種: Bacteria | Archaea
説明: 原核生物のゲノムとプラスミドの配列から、ターミネーター情報をまとめたデータベースです。生物名、遺伝子名から遺伝子下流配列中のターミネーター位置を検索できます。検索されたターミネ... 詳細へ
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運用機関: Korean BioInformation Center
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトの疾病に関連する遺伝子多型と、多型に由来するタンパク質構造、薬剤の関係についての統合データベースです。薬剤ターゲットのタンパク質について、野生型タンパク質の構造と多型由来タ... 詳細へ
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運用機関: Division of Computational Systems Biology, University of Vienna
生物種: Bacteria
説明: EffectiveDBはバクテリアのタンパク質について分泌予測を行った結果を収録したデータベースです。予測は真核生物のドメインとの類似性に基づく手法と、シグナルペプチドの検出に基づく手法の... 詳細へ
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運用機関: お茶の水女子大学 大学院人間文化創成科学研究科
生物種: Embryophyta
説明: 陸上植物のオルガネラ(ミトコンドリアと葉緑体)のRNA編集部位とタンパク質構造に関するデータベースです。RNA編集により生成されるタンパク質のRNA編集部位や置換パターン、アミノ酸の種類... 詳細へ
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運用機関: The Royal Liverpool and NHS Broadgreen Hospitals, University of Liverpool
生物種: Homo sapiens
説明: 免疫関連遺伝子の遺伝子多型に関する地域・民族集団ごとの頻度情報を収めています。ヒト白血球型抗原(HLA)、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)、主要組織適合性複合体クラスI 鎖関... 詳細へ
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運用機関: 広島大学
生物種: Metazoa | Fungi |
Viridiplantae
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説明: 広島大学が保有する植物、動物、化石、岩石、鉱物などの学術標本資料や、生物教材を閲覧できます。 「植物」では、広島大学の植物学研究を特色づけたコケ植物に関する様々な情報や標本、文献... 詳細へ
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運用機関: 社団法人大阪府植物防疫協会
生物種: Embryophyta | Viruses | Arthropoda
説明: 農家、農業技術者、市民を対象とした、花や庭木、野菜、果樹、稲の病害および病害虫の図鑑です。植物の種類ごとに病害と病害虫がまとめられており、病態や病害虫の写真や被害の特徴、発生生... 詳細へ
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運用機関: 近畿大学 生物理工学部
生物種: Embryophyta
説明: 日本でよく見られる500種類の園芸植物の画像と簡単な説明が収録されています。和名、科名、学名で検索できます。また、植物に持つイメージ(ex. 派手な、奇妙な、現代的な)のスコアを入力し... 詳細へ
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運用機関: The CUCKOO Workgroup
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Cavia porcellus | Plasmodium falciparum | ...
説明: CPLMはタンパク質のリジン修飾に関するデータベースです。文献より収集した4万を超える数のタンパク質について、実験的に同定されたリジンの修飾位置と基質情報を収集しています。アセチル化... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種: Mammalia
説明: 理研哺乳類統合データベースは、理研の哺乳類を使用した多数の大規模プロジェクトからもたらされるデータを、継続的に、アクセスしやすく公開するためのデータベースです。FANTOMやENUマウス... 詳細へ
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運用機関: EuPathDB Project Team
生物種: Anncaliia algerae | Edhazardia aedis | Encephalitozoon cuniculi | Encephalitozoon hellem | Encephalitozoon intestinalis | ...
説明: 微胞子虫のゲノム及びゲノムの機能解析結果をまとめた統合データベースです(EuPathDBのファミリーデータベース)。種々の微胞子虫の配列とアノテーションデータを収録しています。遺伝子、... 詳細へ
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運用機関: The Hospital for Sick Children, University of Toronto
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans | Saccharomyces cerevisiae
説明: DAnCERはヒトおよびモデル動物のクロマチン修飾関連遺伝子のデータベースです。文献や種々のゲノムデータベースから実験結果によって確かめられた遺伝子情報を収集し、収録しています。また... 詳細へ
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運用機関: University of Southampton
生物種: Homo sapiens
説明: DBASSは病原性変異によってヒトの遺伝子に生じたスプライス部位の情報を収録したデータベースです。異常な5’または3’スプライス部位の情報を収録した、DBASS3とDBASS5の二つのデータベースか... 詳細へ
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運用機関: 東京大学
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: 本データベースはヒトゲノム多型・変異に生物学的機能注釈を与えるべく、ゲノム変異位置、近傍のエピゲノム(ヒストン修飾、DNAメチル化パターン)、トランスクリプトーム情報(発現量、スプ... 詳細へ
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運用機関: 大阪大学 蛋白質研究所
生物種:
説明: PDBjの教育的コンテンツ (辞典、解説記事、ペーパークラフト素材、ゲーム、過去の講習会の資料など) をまとめて提供しているサイトです。立体的なタンパク質の構造を理解するための一般向... 詳細へ
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運用機関: 岡山県農林水産部農産課
生物種: Tracheophyta | Equisetaceae | Zygnemataceae |
説明: 水田や畑に生息する雑草のデータベースです。雑草の学名、俗称、発生場所や生息状況の説明および写真を収録しています。発生場所やキーワードによる検索が可能です。 詳細へ
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運用機関: 岡山県農林水産部農産課
生物種: Magnoliophyta | Arthropoda | Viruses | Fungi |   
説明: 作物につく病害虫のデータベースです。病害または病害虫の一般名称、学術名称、罹患作物名、被害と見分け方、予防方法および症状の写真を収録しています。作物名や病害虫の発生部位、キーワ... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
説明: 植物の代謝物を分布様式、生物活性ごとに分類し、代謝物、代謝物質の生態学的活性とその対象生物という関係を検索できるデータベースです。代謝物名、代謝物が存在する生物・組織、カテゴリ... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
説明: 食材が持つ効能 (性味,帰経など) と薬膳レシピのデータベースです。食材の効能検索では、効能の他、含有成分、標準成分表、アミノ酸組成表が収録されています。また食材、効能、体質九分類か... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Glycine max | Solanum lycopersicum | Raphanus sativus | Capsicum | Fragaria x ananassa | ...
説明: 作物ゲノム育種研究センターによる作物ゲノム関連データベースのリンク集です。作物全体、ダイズ、ムギ類、果樹類、野菜類、飼料作物類、花き類に関するデータベースが収録(一部今後収録予... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa
説明: 作物ゲノム育種研究センターによるイネゲノム関連データベースのリンク集です。品種特性や実験材料に関するデータベースも紹介されています。 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: cattle | deer | horse | sheep | pig | ...
説明: 家畜疾病の特徴と対策をまとめたデータベースです。ウシ、ウマ、めん羊、ヤギ、豚・イノシシ、家禽の疾病について、罹患動物の種類、特徴と対策が収録されています。法定伝染病や届出伝染病... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa
説明: 農研機構作物研究所から配布可能なイネ遺伝解析材料 (染色体断片導入系統群)の情報を収めたサイトです。コシヒカリ*5/O.rufipogon および いただき*5/O.glumaepatula によって作成された染... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa | Triticum aestivum | Hordeum vulgare | Glycine max | Ipomoea batatas
説明: 農研機構が作製、保管する育成系統 (品種登録前の品種候補) の一覧です。水稲、小麦、大麦、大豆について、系統名、系統育成年、主要特性や栽培適地の情報を収録しています。それぞれの品種... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
生物種: Oryza sativa | Triticum aestivum | Hordeum vulgare | Glycine max | Ipomoea batatas | ...
説明: 農研機構作物研究所が育成した作物新品種の一覧です。イネ、小麦、大麦、大豆、かんしょ、アマランサス、ごまの新品種について、品種名、品種登録年月、交配組み合わせと品種の特性が収録さ... 詳細へ
運用機関: 環境省自然環境局 生物多様性センター
生物種:
説明: 生物多様性データを統合的に共有化する目的で、全国の生物情報を集積、共有、提供しているシステムです。観察された生物の確認年月日と場所、和名、学名、写真、報告者が登録されています。... 詳細へ
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運用機関: Howard Hughes Medical Institute
生物種:
説明: タンパク質ファミリーに関する物理的相互作用のデータベースです。Protein DataBank(PDB)から抽出した既知タンパク質構造から計算されたタンパク質ドメイン間の相互作用、リガンドとの相互... 詳細へ
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運用機関: EMBL-EBI
生物種: Metazoa | Ascomycota | Codonosigidae | Arabidopsis thaliana |
説明: 動物のゲノムから推測される遺伝子の系統関係のデータベースです。種々の動物ゲノムの配列情報を用いて、オーソログやパラログについての信頼できるキュレーションされた情報を提供すること... 詳細へ
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運用機関: University of Montana
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Danio rerio | Nematoda | Drosophila
説明: 完全長の真核生物ゲノムにおける反復DNA配列の配列アライメント、隠れマルコフモデル、適合リストのコレクションです。配列の説明、記載文献、分類、モデルとdfam配列間での一致度などを収録... 詳細へ
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運用機関: jPOSTプロジェクト
生物種:
説明: 本DBは、国内外に散在している種々のプロテオーム情報を標準化・統合・一元管理し、データベース化したもので、多彩な生物種の翻訳後修飾や絶対発現量等 の情報まで網羅したプロテオーム統合... 詳細へ
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運用機関: 名古屋大学 トランスフォーマティブ生命分子研究所
生物種: Torenia
説明: トレニアゲノムプロジェクトで明らかとなったトレニア (Torenia; ツルウリクサ属) のゲノムや遺伝子の塩基配列などを提供するデータベースです。cDNA塩基配列、ORF、遺伝子発現領域、シロ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人海洋研究開発機構 地球環境観測研究開発センター
生物種: Foraminifera
説明: 世界の海洋に生息する単細胞の原生動物プランクトン「浮遊性有孔虫」のデータベースです。種の分類や殻、口孔、棘状突起などの形態的特徴の解説に加えて光学顕微鏡画像、電子顕微鏡(SEM)画... 詳細へ
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運用機関: ORFeome Collaboration
生物種: Homo sapiens
説明: 国際共同研究グループ The international ORFeome Collaboration (OC) が提供する完全長で精度の高いヒトのORFクローンのデータベースです。29,597クローンで、RefSeq や Ensembl に収録され... 詳細へ
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運用機関: カビアレルゲンデータベース
生物種: Aspergillus luchuensis | Aspergillus kawachii | Aspergillus niger CBS 513.88 | Aspergillus niger ATCC 1015
説明: カビ(真菌)のアレルゲン情報のデータベースです。IUIS Allergen database (http://www.allergen.org) から真菌類のデータを抽出し、4種類の菌 (黒麹菌、白麹菌、A. niger CBS、A. nige... 詳細へ
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運用機関: University of Leipzig, University of Strasbourg
生物種: Eumetazoa | Placozoa | Porifera
説明: ミトコンドリアtRNA遺伝子のデータベースです。約1500種の全シークエンスされた後生動物のミトコンドリアRefSeqゲノムのうち3つ組アンチコドンのアミノ酸選択性により分類された30,000以上の... 詳細へ
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運用機関: Shujiro Okuda laboratory
生物種: Bacteria | Archaea
説明: 人体と地球上の環境に生息する微生物と微生物層についてのゲノムとバーチャルメタゲノム(微生物コミュニティーにおける16S rRNAsから再構成したもの)のデータベースです。公共のデータベー... 詳細へ
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運用機関: Screening Committee of Anticancer Drugs (SCADS)
生物種: Homo sapiens
説明: 化合物の制がん作用と関連する遺伝子発現変化の情報を提供するデータベースです。5種類のヒトがん細胞株(結腸がん HT-29,卵巣がん SKOV3,白血病 K562,肺がん H2228,肺がん PC-9)をさま... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人理化学研究所
生物種:
説明: 理化学研究所の天然化合物バンク (RIKEN NPdepo) に登録されている化合物を検索するデータベースです。化合物の名称、CAS番号、分子量、構造、InChI情報等を収録しています。生理活性やスペ... 詳細へ
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運用機関: Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (MSKCC)
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | Drosophila melanogaster | Caenorhabditis elegans
説明: マイクロRNAターゲット予測と発現プロファイルの包括的なデータベースです。ターゲット予測はmiRandaアルゴリズムの発展によって、発現プロファイルは哺乳類の組織や正常および疾病由来の細... 詳細へ
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運用機関: Nigel Collier
生物種:
説明: Web 上のニュース記事を利用した感染症監視システム(BioCaster)で使用する目的で作成された、感染症に関するオントロジーです。病原体、症状、感染経路、宿主生物に関して、概念の定義と概... 詳細へ
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運用機関: 京都大学 iPS細胞研究所
生物種: Homo sapiens
説明: 京都大学iPS細胞研究所 (CiRA) の研究活動を紹介するサイトです。「研究材料の提供」ページでは、提供可能なヒトやマウスのiPS細胞や疾患特異的iPS細胞、マウスのES細胞やDNA試料等がリスト... 詳細へ
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運用機関: Dana-Farber Cancer Institute
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Rattus
説明: 公開された文献から手動でキュレートした遺伝子シグニチャー (遺伝子発現解析結果からの変動遺伝子群) のデータベースです。主にがん、幹細胞、免疫細胞、発生、肺疾患に関連する遺伝子発... 詳細へ
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運用機関: 慶應義塾大学
生物種: Dugesia japonica
説明: プラナリアESTのデータベースです。独自に開発したプラナリア無性生殖個体を有性生殖個体に転換させる系(有性化)を用いて、有性化個体からcDNAライブラリを作成しました。ESTおよびクラスタ... 詳細へ