データベースのレコード一覧  (全 1709件)

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運用機関: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所
生物種:
説明: 医薬基盤・健康・栄養研究所が公開している16のデータベース(生物資源および研究データ)を横断的に検索できるシステムです。キーワードを入力し、対象のデータベースを選択した検索の他、... 詳細へ
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運用機関: 日本環境変異原学会
生物種: Homo sapiens | Bacteria | Salmonella Typhimurium | Escherichia coli | Drosophila | ...
説明: 天然物を含め、食品や食品添加物、医薬品や医療用品、農薬などのほか、それらの材料として使用されてきた既存の工業用化学物質に対して国内外で行われた変異原性試験の結果を収集したデータ... 詳細へ
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運用機関: 難病プラットフォーム
生物種: Homo sapiens
説明: 日本医療研究開発機構(AMED)の「難治性疾患実用化研究事業」および厚生労働省が所管する「難治性疾患政策研究事業」で行われている難病を対象としたレジストリ研究の共通基盤を提供するサ... 詳細へ
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運用機関: 東京大学医学部附属病院
生物種: Homo sapiens
説明: 東京大学医学部附属病院脳神経外科で開発された健常成人(アジア人男性)の頭部解剖構造の3次元コンピュータグラフィックス(ポリゴンモデル)です。検体データを基礎とし、複数の教科書や医... 詳細へ
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運用機関: Neotoma Leadership Council
生物種: Spermatophyta | Vertebrata | Bacillariophyta | Ostracoda | Insecta | ...
説明: コミュニティベースの古生態学データベースです。約500万年前からの花粉、哺乳類、珪藻、貝形虫などの化石のデータおよび地質学データを含みます。ユーザーはCC BY 4.0の利用条件の下でデー... 詳細へ
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運用機関: 国立科学博物館
生物種: Tracheophyta
説明: 日本の絶滅危惧維管束植物(環境省 2012)について、周辺地域となる中国、韓国、台湾、ロシア東部における分布と状態(絶滅危惧あるいは非絶滅危惧)を、各国および各地域のレッドリストをも... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター, TEC group
生物種: Escherichia coli
説明: 大腸菌の全シグマ因子・転写因子とその制御標的遺伝子セットを格納したデータベースです。新規に開発したGonomic SELEX法により、全シグマ因子・転写因子の認識配列を同定しています。転写因... 詳細へ
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運用機関: 東京大学, 国立研究開発法人 森林研究・整備機構, 地方独立行政法人 北海道立総合研究機構, 明治大学
生物種: Abies sachalinensis
説明: トドマツのトランスクリプトームデータベースです。網羅的に収集された、トドマツの主要な器官(雄花、雌花、新葉、内樹皮)で働く遺伝子の発現と塩基配列情報およびアノテーションを提供し... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種: Allium cepa | Allium cepa var. aggregatum | Allium roylei | Allium fistulosum
説明: ネギ属のトランスクリプトームデータベースです。次世代シークエンサーによるRNA-Seqで、日本ネギ(A. fistulosum, FF)、Shallot (A. cepa Aggregatum group, AA)、Shallot由来の余分な染色... 詳細へ
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運用機関: 大阪府立大学大学院 生命環境科学研究科 緑地環境科学専攻
生物種: Embryophyta
説明: 大阪府立大学のキャンパスに生育する200種以上の樹木を紹介しています。種名・科名・花やたねおよび風景の写真から樹木の検索ができます。 詳細へ
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運用機関: 大阪府立大学大学院 生命環境科学研究科 緑地環境科学専攻
生物種: Aves
説明: 大阪府立大学とその隣にあるにさんざい古墳で観察された野鳥約40種を紹介しています。種名・科名・および風景の写真から検索ができます。 詳細へ
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運用機関: 東邦大学 理学部 生物分子科学科
生物種: Homo sapiens
説明: 核内受容体constitutive androstane receptor(CAR)のヒトゲノム内の結合部位配列および結合部位内のrSNPs (regulatory SNPs) の情報を提供するサイトです。改良型Y1H法を用いて同定された... 詳細へ
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運用機関: 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種: Bacteria | Archaea | Viruses | Eukaryota
説明: ウィルスとその宿主をNCBI taxonomy IDのペアとして整理したデータベースです。NCBI/RefSeq、またはアクセッション番号がEBI GenomesにリストされたGenBankに完全長ゲノム配列が置かれている... 詳細へ
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運用機関: 大阪府立大学大学院 生命環境科学研究科 緑地環境科学専攻
生物種: Embryophyta
説明: 大阪府立大学キャンパスおよび森林、公園、緑化現場などで出現した樹木の実生画像約170種を紹介しています。 詳細へ
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運用機関: 東邦大学 理学部 生物分子科学科
生物種: Homo sapiens
説明: 核内ホルモン受容体スーパーファミリーで転写因子として働く retinoid X receptor (RXR) のヒトゲノム内の結合部位配列および結合部位内のrSNPs (regulatory SNPs) の情報を提供するサイトで... 詳細へ
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運用機関: 東北大学 大学院情報科学研究科
生物種: Chlamydomonas reinhardtii | Cyanidioschyzon merolae
説明: 微細藻類の遺伝子共発現データベースです。公共データベース (Sequence Read Archive: http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01098, Gene Expression Omnibus: http://integbio.jp/dbcat... 詳細へ
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運用機関: Japan Paleobiology Database
生物種: Metazoa | Bacteria | Haptophyceae | Stramenopiles | Fungi | ...
説明: 日本国内の大学・博物館・資料館などが所蔵する古生物標本を横断的に検索できるデータベースです。当該機関から提供された学名、記載著者名、産地や年代などの標本情報と所蔵機関名を収録し... 詳細へ
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運用機関: 長浜バイオ大学
生物種: Homo sapiens
説明: ヒトの疾患に関連する遺伝子多型を可視化するサイトです。dbSNP、ClinVar、COSMIC、OMIM、RAPIDなどから収集した情報を統合し、多型マップ、アミノ酸配列、タンパク質の3次元構造、SNP ID変... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人長尾自然環境財団
生物種: Chondrichthyes | Actinopterygii | Lepidosauria | Amphibia | Decapoda | ...
説明: 東南アジアの淡水魚を中心とする標本データベースです。ラオス、タイ、カンボジア、ベトナム、マレーシア、ミャンマー、および日本に生息する淡水魚、水生昆虫、貝類の生態写真や標本写真、... 詳細へ
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運用機関: 公益財団法人 かずさDNA研究所
生物種: Fagopyrum esculentum
説明: ソバのゲノムデータベースです。NGSによって得られたショートリード配列を用いてドラフトゲノムを決定し、遺伝子予測解析により決定されたCDSについて、NCBI NRまたはTAIR 10データベースに... 詳細へ
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運用機関: 千葉大学 真菌医学研究センター
生物種: Fungi | Actinobacteria
説明: 千葉大学真菌医学研究センターが収集、寄託された病原性真菌および放線菌の情報です。種名、単離日、遺伝子型、血清型、バイオハザードレベルなどの情報を収録しています。真菌リスト、放線... 詳細へ
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運用機関: 自然科学研究機構 基礎生物学研究所
生物種: Archaea | Bacteria | Apicomplexa | Mycetozoa | Fungi | ...
説明: 大規模な比較ゲノム解析を行うためのワークベンチです。クライアント・サーバ型システムで、MBGD (Microbial Genome Database for Comparative Analysis) (NBDC00130) サーバに接続してその... 詳細へ
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運用機関: 認定特定非営利活動法人 健康と病いの語りディペックス・ジャパン
生物種: Homo sapiens
説明: 病気の診断を受けた人やその家族が、同じような経験をした人たちの「語り」に触れて、 病気と向き合う勇気と知恵を身につけるために作られたウェブサイトです。認知症、乳がん、前立腺がん、... 詳細へ
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運用機関: 特定国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター
生物種: Arabidopsis thaliana
説明: シロイヌナズナ二次代謝産物の液体クロマトグラフィー/質量分析(LC-MS)によるプロファイルデータベースです。シロイヌナズナ野生型(Col-0)の部位別、発生段階別代謝物プロファイルデータ... 詳細へ
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運用機関: 株式会社 生命誌研究館
生物種: Parasteatoda tepidariorum | Ligia exotica | Caridina multidentata | Hexapoda | Viridiplantae
説明: 生命誌研究館が提供するデータリソースのポータルサイトです。Pt_spiderBASE (日本産オオヒメグモのデータベース)、Pt_spider Image/Movie Database (日本産オオヒメグモの画像や動画のデー... 詳細へ
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運用機関: 東北大学 大学院医学系研究科 附属創生応用医学研究センター
生物種: Homo sapiens
説明: PDBに含まれるタンパク質を配列相同性を用いてヒトゲノムにマッピングしたBAM形式ファイル(pdbBAM)をダウンロードして利用できます。pdbBAM をゲノムブラウザで読み込むことで、個人ゲノム... 詳細へ
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運用機関: International Institute of Molecular and Cell Biology in Warsaw
生物種: Homo sapiens | Escherichia coli | Saccharomyces cerevisiae
説明: DNAの損傷と修復機構に関わる因子のデータベースです。タンパク質、損傷原因因子、DNA修復タンパク質の異常に起因する疾患、ホモログ情報、損傷修復パスウェイ、キーワード、論文の各カテゴ... 詳細へ
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運用機関: 創価大学 理工学部
生物種: Bacteria | Fungi | Homo sapiens | Mus musculus | Rattus norvegicus | ...
説明: 糖鎖構造のグループの中から共通の構造を見つけることができる糖鎖マルチアラインメントツールMCAWによって得られた糖鎖プロファイルデータベースです。Consortium of Functional Glycomics ... 詳細へ
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運用機関: 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター
生物種: Viridiplantae
説明: 植物代謝産物とそれに相互作用するヒトタンパク質情報やヒトに対する効能情報を統合したデータベースです。KNApSAcKの植物とそれに由来する代謝産物の情報、ChEMBLの化合物とタンパク質の相... 詳細へ
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運用機関: エルピクセル株式会社
生物種:
説明: バイオイメージング用途の画像解析ソフトウェアImageJのプラグインパッケージです。種々の画像処理や画像解析を高効率かつ適応的に行うことを可能にします。 詳細へ
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運用機関: 創価大学 理工学部
生物種:
説明: RINGSは糖鎖(構造)解析のためのリソースです。 大量の糖鎖構造の中から頻繁に出現する糖鎖の部分構造を抽出するツール(GlycanMiner)や、糖転移酵素によるN型糖鎖の生合成を予測するため... 詳細へ
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運用機関: 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ センター
生物種:
説明: WABI は、 DDBJの検索サービス を Web画面を介せずに利用できる Web API です。BLAST、getentry、ARSA、ClustalW、VecScreen、MAFFT の Web API を提供しています。 詳細へ
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運用機関: Computational Epigenomics Lab, Evolutionary Genomics and Bioinformatics Group, Dept. of Genetics, Inst. of Biotechnology, University of Granada
生物種: Homo sapiens | Mus musculus | Arabidopsis thaliana | Pan troglodytes | Rhesus macaque | ...
説明: NGSmethDBは次世代シーケンサーから得られるホールゲノムでのメチル化データのデータベースです。主にNCBI GEOやROADMAP projectkからダウンロードされたセルラインや組織のシークエンスプロ... 詳細へ
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運用機関: 明治大学 農学部 生命科学科・バイオインフォマティクス研究室
生物種: Arabidopsis thaliana | Oryza sativa
説明: イネ、シロイヌナズナの遺伝子発現ネットワーク(GEN)情報データベースです。マイクロアレイデータおよび予め計算されたGENデータが保存されています。イネ(OryzaExpress)、シロイヌナズ... 詳細へ
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運用機関: 東京大学 総合研究博物館
生物種: Aceraceae | Adoxaceae | Annonaceae | Aquifoliaceae | Araceae | ...
説明: 東京大学 総合研究博物館で保存している植物タイプ標本のデータベースです。種および種以下で分類されたタイプ標本について、学名、タイプの種別、写真、採取場所、関連文献のデータが整理さ... 詳細へ
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運用機関: Max Planck Institute for Informatics
生物種: Homo sapiens
説明: DeepBlueは、主なエピゲノムプロジェクトであるENCODE、NIH Roadmap、BLUEPRINT、DEEPに収録されたエピゲノムデータを包括的に検索、フィルタリング、ダウンロードするためのAPIとウェブイン... 詳細へ
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運用機関: 特定国立研究開発法人理化学研究所
生物種: Oryzias
説明: メダカ系統のリソースデータベースであるNBRP Medaka( https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00147 )のメタデータを体系的に整理して提供しています。メダカ系統、アレル、遺伝子、解... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種:
説明: purl(Persistent Uniform Resource Identifier)を作成、保持するサーバーです。オリジナルのWebリソースにリダイレクトするPURLを作成、登録、公開することで、オリジナルのWebリソースへ... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター
生物種: Homo sapiens
説明: NBDCヒトデータベース (http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01348) などの公開系データベースからデータを公開するのに先駆けて、プロジェクト内やグループ内におけるデータの共有を... 詳細へ
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運用機関: 千葉大学 真菌医学研究センター
生物種: Fungi | Actinobacteria | Amoeba | Babesia | Blastocystis | ...
説明: NBRP病原真核微生物では、病原真菌・放線菌・原虫の収集・保存・提供を行っています。キーワード検索により菌株情報へのアクセスができ、リソース保有機関へ分譲依頼も行うことができます。... 詳細へ
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運用機関: 岐阜大学 研究推進・社会連携機構 微生物遺伝資源保存センター
生物種: Bacteria
説明: NBRP病原細菌では、感染症及びヒトの健康に関わる細菌の収集、保存、提供を行っています。キーワード検索により菌株情報へのアクセスができ、リソース保有機関へ分譲依頼も行うことができま... 詳細へ
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運用機関: 国立研究開発法人産業技術総合研究所
生物種: Arabidopsis thaliana | Dianthus caryophyllus | Cyclamen persicum | Chrysanthemum morifolium | Eustoma exaltatum subsp. Russellianum | ...
説明: 「花きCRES-Tプロジェクト」において、シロイヌナズナの様々な転写因子を標的にしてキメラリプレッサー遺伝子サイレンシング法 (CRES-T法)により作成した形質転換体の表現型を収録したデータ... 詳細へ
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運用機関: J. Craig Venter Institute (JCVI)
生物種: Medicago truncatula
説明: マメ科のモデル植物であるタルウマゴヤシ(Medicago truncatula)のゲノムデータベースです。最新のゲノム配列・アノテーション情報を提供しています。キーワード検索やBLAST検索、データの... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
説明: アルカロイドのパスウェイマップを集めたデータベースです。マップ内に記述される代謝物名(複数指定可)または生物種を指定すると、リスト上のパスウェイマップIDや、マップ上のオブジェク... 詳細へ
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運用機関: Structural Bioinformatics Group, National University of Quilmes
生物種: Bacteria | Eukaryota | Archaea | Viroids | Viruses
説明: タンパク質のコンフォメーションの多様性に関するデータベースです。PDBに登録されたタンパク質について重複する結晶構造をまとめて、収録しています。PDB、Uniprot、CATHのID、コンフォメー... 詳細へ
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運用機関: 奈良先端科学技術大学院大学
生物種:
説明: 代謝物の構造相同性のデータベースです。KNApSAcK CIDと類似度を設定すると、指定した代謝物と構造相同性をもった代謝物の代謝物ID、名称、構造、類似度が一覧として表示されます。KNApSAcK ... 詳細へ
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運用機関: Barts Cancer Institute
生物種: Homo sapiens | Mus musculus
説明: 膵臓由来の遺伝学データを収録しているデータベースです。トランスクリプトーム、プロテオーム、メチレーション、miRNAの研究から得られる遺伝子発現データベースとゲノムの研究から得られる... 詳細へ
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運用機関: National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University
生物種: Oryza sativa
説明: イネの遺伝的多様性および機能アノテーションに関する包括的なデータベースです。17,397,026の遺伝子多型(14,541,446のSNPおよび2,855,580のsmall INDEL)の情報および、13の農業形質と840... 詳細へ
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運用機関: International Rice Research Institute
生物種: Oryza sativa
説明: イネの遺伝子型・表現型・多様性情報を提供するデータベースです。SNP/indelおよび多様性/表現型情報の検索・ダウンロード、イネゲノム参照配列のブラウジングが可能です。データの一括ダウ... 詳細へ
運用機関: 国立研究開発法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター, 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
生物種: Homo sapiens
説明: TogoVar(日本人ゲノム多様性統合データベース)は、日本人ゲノム配列の個人による違い(バリアント)とそれに関係する疾患情報などを収集・整理したデータベースです。TogoVarは、研究プロ... 詳細へ