休止
(14日以上)
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ChimerDB
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Ewha Womans University |
| 運用機関所在国・地域: | 大韓民国 |
| 説明: | ChimerDBは融合遺伝子の情報を集めたデータベースです。ChimerKB、ChimerPub、ChimerSeqの3つのモジュールで構成されています。 ChimerKBは、文献や公開されているリソースからのマニュアルキュレーションによって、実験に基づいた融合遺伝子についての、疾患との関係や配列等の知識情報を収録しています。ChimerPubは、PubMed Abstractからのテキストマイニングによって得られた融合遺伝子の情報を収録しており、テキストマイニングに基づいて要旨に注釈がつけられています。ChimerSeqは、シークエンスデータからの融合遺伝子候補を格納できるよう設計され、多様な癌患者を含むTCGAプロジェクトのRNAシーケンスデータから得られた融合遺伝子候補を収録しています。 遺伝子名、遺伝子ペア名、疾患名による検索や各種絞り込みのメニューがあります。また、データベーススキーマ、MySQLダンプファイル、エクセルフォーマットでのデータの一括ダウンロードが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 健康/疾患, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 書誌/ドキュメント |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://203.255.191.229:8080/chimerdbv31/mdownload.cdb |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://203.255.191.229:8080/chimerdbv31/mdownload.cdb |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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BioXpress ICGC Data Portal EDK Komugi GSP 統合がんゲノムデータポータル lncRNAdb snoRNABase HOMOPHILA CCDB Genomics England | PanelApp |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2018-04-30 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |