休止
(1日目)
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Araport: Arabidopsis Information Portal
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| 運用機関名: | J. Craig Venter Institute, Texas Advanced Computing Center, The University of Texas at Austin, University of Cambridge |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | シロイヌナズナの研究情報のポータルサイトです。ゲノムアノテーションデータTAIR10の後継にあたるAraport11データを無料で提供しています。ゲノム配列や機能に加えて、RNA-seqデータが統合されています。ウェブアプリケーションThaleMine、ゲノムブラウザJBrowseを利用してデータの検索・表示および解析を行なうことができます。ユーザーが開発できる「Science Apps」やAPIも用意されています。解析結果の保存やデータのダウンロード、Science Appsの利用には無料アカウントの作成が必要です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, DNA, RNA, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ, ポータル |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://www.araport.org/downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | https://www.araport.org/data/araport11 |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://www.araport.org/thalemine/user-guide, https://www.araport.org/jbrowse/user-guide, https://www.araport.org/tutorials |
| データベースの連絡先: | araport[at]jcvi[dot]org |
| API / SPARQL endpoint: | https://www.araport.org/api-explorer |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-001076/ |
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類似データベース:
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Genome Sequence Archive GeneProf The UCSC Archaeal Genome Browser CistromeDB V. parahaemolyticus Genome Information ENPD Yeast Searching for Transcriptional Regulators and Consensus Tracking FANTOM5 D3G Pseudomonas Genome Database V2 |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-07-10 |
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レコード最終更新日:
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2019-07-10 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |