休止
(14日以上)
(14日以上)
PODC: Plant Omics Data Center
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | |
| URL: | |
| 運用機関名: | 明治大学 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 高速シーケンサーにより得られた遺伝子発現プロファイルデータをもとに、文献情報に基づく知識情報を組み合わせた遺伝子発現ネットワーク情報を提供するデータベースです。種々の植物の遺伝子について、遺伝子名、説明、発現プロファイル、転写因子・シス因子情報、予想される遺伝子機能等の情報、他の遺伝子との発現ネットワーク、パラログやオルソログ情報などをマニュアルキュレーションおよび自然言語処理により集積、提供しています。遺伝子、機能、サンプル条件、転写因子・シス因子に対するキーワード検索のほか、BLAST検索、GEN（gene expression network）検索も可能です。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://plantomics.mind.meiji.ac.jp/podc/bulkDownload.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://plantomics.mind.meiji.ac.jp/podc/img/README_PODC_bulkDownload.txt |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
ALCOdb MSigDB YPA Genome Network Platform Open Regulatory Annotation Rubber Genome & Transcriptome Database GENIES ATTED-II PlantExpress FlyMine |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2016-02-23 |
|
レコード最終更新日:
|
2018-04-05 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |