MatrisomeDB
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| 運用機関名: | Koch Institute for Integrative Cancer Research at MIT, University of Illinois at Chicago |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 細胞外マトリックス (ECM) に関するプロテオームデータを統合するデータベースです。 コラーゲン、ECM糖タンパク質、プロテオグリカンなどECMの主要物質や、生体サンプル（ヒト、マウス、異種移植）、組織や腫瘍の種類による絞り込みが可能です。結果は信頼スコアで色分けされたヒートマップ（横軸がタンパク質、縦軸が組織）で示され、ヒートマップ作成に使用された実験データをまとめてダウンロードすることもできます。検出されたペプチドの遺伝子、タンパク質情報や実験の生データへのリンクなども表形式で提供されています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | タンパク質, 細胞/オルガネラ |
| タグ (データの種類): | 発現, 局在, リポジトリ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://matrisomedb.org/tutorial/ |
| データベースの連絡先: | https://matrisomedb.org/about/ |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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jPOST Human Protein Atlas CYCLoPs LocDB CropPAL MiCroKiTS Compartmentalized Protein-Protein Interaction Haemosphere ProteomicsDB Soybean Proteome Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-04-28 |
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レコード最終更新日:
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2023-01-15 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |