TerrestrialMetagenomeDB
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Helmholz-Zentrum for Environmental Research |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ |
| 説明: | 陸生のマイクロバイオーム研究に関わるメタゲノムデータのレポジトリとしてメタデータを収録しているデータベースです。主要レポジトリである MG-RAST と Sequence Read Archive (SRA) からキュレートしたメタゲノムデータを比較、関連付けられるように、データセットのメタデータリストと世界地図からデータを選択できるインタラクティブ地図を備えています。リストにはプロジェクトID、サンプルID、サンプリング環境などが含まれています。リソースDB、シーケンシングプラットフォーム、サンプル形状、サンプリング環境などによる絞り込みが可能です。各メタゲノムデータ自体もダウンロードできるスクリプトが提供されています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 環境 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://webapp.ufz.de/tmdb/session/c2744a2559c3386a51e8f517a401f619/download/download_explorerData?w= |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://www.youtube.com/playlist?list=PLmPZiWwqlBpDQWRFduzh9tBLmZqVb4mQH |
| データベースの連絡先: | https://webapp.ufz.de/tmdb/ |
| API / SPARQL endpoint: | https://github.com/tmdb-team/tmdb |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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gcMeta 農業防災気象ネット KEGG MGENES JaLTER Metacat サービス Earthref.org インドネシアアカシア林地気象観測データ公開ページ Microbiome Datahub MGnify KEGG Metagenomes JFODB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-03-30 |
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レコード最終更新日:
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2022-03-30 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |