CREEDS: Crowd Extracted Expression of Differential Signatures
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| 運用機関名: | Icahn School of Medicine at Mount Sinai |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 遺伝子、疾患、薬物間の関連性についてのデータベースです。Gene Expression Omnibus (GEO) から得られた大量の遺伝子発現プロファイルを注釈付けし再分析するクラウドソーシングプロジェクトによって、単一遺伝子摂動、疾患と正常の対比、薬物摂動が手動で注釈付けられています。また、遺伝子の関連性がBubble ChartやClustergramにより可視化されています。各シグネチャには遺伝子名、機能、GEO ID、発現細胞、Enrichrによる上流や下流遺伝子情報へのリンクなどが収録されています。キーワードや上流下流遺伝子セットによる検索が可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://amp.pharm.mssm.edu/creeds/#downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://amp.pharm.mssm.edu/creeds/ |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | http://amp.pharm.mssm.edu/creeds/#help |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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MSigDB ALCOdb Oncomine RhesusBase National Microbial Pathogen Data Resource FusionGDB2 Tumor Associated Gene database ADMIX database ED-Genes The RAS/MAPK Syndromes Homepage |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-12-23 |
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レコード最終更新日:
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2020-12-23 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |