ID: | NBDC02419 |
名称: | GenEpid-J |
別称: | Database of Pathogen Genomics and Epidemiology |
URL: | https://gph.niid.go.jp/genepid-j/ |
運用機関名: | 厚生労働省 国立感染症研究所 (J-Globalへのリンク) |
運用機関所在国・地域: | 日本 |
説明: | 薬剤耐性菌のゲノムデータベースです。国内外で分離された患者・家畜・環境など様々な由来の菌株について、プラスミドゲノムと染色体ゲノムを分離したうえで解読・解析し、付随する疫学情報と共にデータベースとして蓄積しており、特定の耐性遺伝子についてその分布状況を迅速に把握することができます。AMED研究班員のみ内部データベースが利用できます。外部研究者が閲覧できるのは、薬剤耐性菌(AMR)およびコレラ菌についての解読・登録数の外観のマップ表示のみですが、関連の各種ツールが利用できます。 |
生物種: | Escherichia coli (562), Klebsiella pneumoniae (573), Enterobacter cloacae (550), Salmonella (590), Klebsiella oxytoca (571), Serratia marcescens (615), Enterococcus faecium (1352), Klebsiella aerogenes (548), Citrobacter freundii (546), Pseudomonas aeruginosa (287), Vibrio cholerae (666), Dengue virus (12637), Staphylococcus (1279), Mycobacterium tuberculosis (1773), Norovirus (142786) |
タグ (対象): | ゲノム/遺伝子, 薬, 遺伝的多様性, 個体/種, 健康/疾患 |
タグ (データの種類): | 表現型, 環境, 配列, 地理的分布 |
論文等 (PubMed ID/DOI): | |
言語: | 英語 |
稼動状況: | 稼動中 |
一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
データベースの使い方 | ― |
データベースの連絡先: | ― |
API / SPARQL endpoint: | ― |