ID: | NBDC02594 |
名称: | gGENEPID |
別称: | Global Genome Epidemiology Database |
URL: | https://gph.niid.go.jp/ggenepid |
運用機関名: | 厚生労働省 国立感染症研究所 (J-Globalへのリンク) |
運用機関所在国・地域: | 日本 |
説明: | 病原体ゲノム情報と疫学調査解析 (年・地域・由来) を統合したデータベースです。感染症法に規定される35菌種のゲノム情報をNCBIの公開データから収集、解析し、生物種ごとにプロジェクト名(NCBIリンク)、地域、生物種、疾病、サンプル収集年月の一覧にまとめています。地域、発表年を指定すると発表件数の時系列による増減が世界地図上の円の大小として表示され、時間の経過と共にどの地域で報告件数が増加しているかが把握しやすくなっています。 |
生物種: | Bacilli (91061), Betaproteobacteria (28216), Clostridia (186801), Epsilonproteobacteria (29547), Gammaproteobacteria (1236), Mycobacteriaceae (1762) |
タグ (対象): | ゲノム/遺伝子, 個体/種, 健康/疾患 |
タグ (データの種類): | 配列, 地理的分布, 書誌/ドキュメント |
論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
言語: | 英語 |
稼動状況: | 稼動中 |
一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
データベースの使い方 | ― |
データベースの連絡先: | ― |
API / SPARQL endpoint: | ― |