Plant GARDEN: Plant Genome And Resource Database ENtry
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| 運用機関名: | 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | さまざまな植物のゲノムやマーカー情報を集めたポータルサイトです。ゲノム配列、マーカー（SSR, CAPS, SCARなど）、Bio Sample、アノテーション（gff/gff3）、遺伝子（cds/gene）、転写物（cDNA/mRNA）、タンパク質配列（pep/aa）などの情報を収録しています。植物種、形質、配列からの検索や、SNPやIn/Delを検出する解析パイプラインを使った解析が可能です。また、全リストからはアッセンブルされた配列やSRA配列の情報が絞り込めます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質, cDNA/EST, 遺伝的多様性, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 表現型, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://plantgarden.jp/app/pc_11.html |
| データベースの連絡先: | https://plantgarden.jp/app/pc_01.html |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=lecture&page=1&query=Plant GARDEN |
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TOMATOMICS Soybean Marker Database PEDE Mouse Phenome Database Raphanus sativus Genome DataBase KaTomicsDB RiceVarMap v2.0 The Autism Chromosome Rearrangement Database Daphnia Water Flea Genome Database SNPSTR |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-05-14 |
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レコード最終更新日:
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2022-01-24 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |