ID: | NBDC02416 |
名称: | Plant GARDEN |
別称: | Plant Genome And Resource Database ENtry |
URL: | https://plantgarden.jp/ |
運用機関名: | 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク) |
運用機関所在国・地域: | 日本 |
説明: | さまざまな植物のゲノムやマーカー情報を集めたポータルサイトです。ゲノム配列、マーカー(SSR, CAPS, SCARなど)、Bio Sample、アノテーション(gff/gff3)、遺伝子(cds/gene)、転写物(cDNA/mRNA)、タンパク質配列(pep/aa)などの情報を収録しています。植物種、形質、配列からの検索や、SNPやIn/Delを検出する解析パイプラインを使った解析が可能です。また、全リストからはアッセンブルされた配列やSRA配列の情報が絞り込めます。 |
生物種: | Viridiplantae (33090) |
タグ (対象): | ゲノム/遺伝子, タンパク質, cDNA/EST, 遺伝的多様性, 個体/種 |
タグ (データの種類): | 配列, 表現型, 発現 |
論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
言語: | 日本語, 英語 |
稼動状況: | 稼動中 |
一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
データベースの使い方 | https://plantgarden.jp/app/pc_11.html |
データベースの連絡先: | https://plantgarden.jp/app/pc_01.html |
API / SPARQL endpoint: | ― |