RECOG: Research Environment for Comparative Genomics
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| 運用機関名: | 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 大規模な比較ゲノム解析を行うためのワークベンチです。クライアント・サーバ型システムで、MBGD (Microbial Genome Database for Comparative Analysis) (NBDC00130) サーバに接続してそのデータを利用することができます。多数の生物種のゲノム間でオーソログの対応付けを行い、そのオーソログテーブルを基に様々な比較解析を行うことができます。ローカル環境にダウンロードして、公開ゲノムデータに利用者のゲノムを加えた上でオーソログテーブルを作成し、比較解析を行うことも可能です。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 生物分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://mbgd.genome.ad.jp/RECOG/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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MBGD GenomeSync UNITE Evolutionary Genealogy of Genes: Non-supervised Orthologous Groups OHNOLOGS Description of Plant Viruses Silver Project: Ape Genome Sequencing TreeBase 系譜情報データベース： Pedigree Finder ECGB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2018-12-04 |
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レコード最終更新日:
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2023-09-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |