IMG/M: the integrated metagenome data management and comparative analysis system
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | Biological Data Management and Technology Center, Lawrence Berkeley National Laboratory |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 微生物のゲノムとマイクロバイオームのデータセットについてアノテーション、解析、分配をサポートするサイトです。DOE's Joint Genome Institute (JGI)で得られた配列にEBI Genome Reviews、RefSeq、UniProt/SwissProt、 UniProt/TrEMBL、InterPro、GO、Pfam、 KEGGなどから得られる情報を統合しています。また、公開方針に同意したユーザーから提供されたデータセットも収録し、公開しています。各データセットには生物名、GOLDデータベースへのリンクやトータルの塩基数、遺伝子数、機能予測した遺伝子などの情報および折り畳みやコンティグのゲノムブラウザ、染色体マップが収録されています。遺伝子、機能、ゲノムブラウザからの検索が可能です。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 書誌/ドキュメント, 配列, オントロジー/用語/命名法, 分類, 発現, 3D構造, 環境, 相互作用/パスウェイ, 表現型, 手法 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
レコード管理者:
|
See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
|
レコードの由来:
|
 (2018-12-21)
|
|
レコード公開日:
|
2019-03-28 |
|
レコード最終更新日:
|
2019-07-06 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |