The Mass Genome Annotation Data Repository: MGA
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| 運用機関名: | Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, SIB Swiss Institute of Bioinformatics |
| 運用機関所在国・地域: | スイス |
| 説明: | 公開された次世代シーケンシングデータおよび その他のゲノムアノテーションデータ（転写開始部位、SNP など）を標準フォーマット（SGA: Simple Genome Annotation）で保存するリポジトリです。配列の生データではなく、各生物種ゲノムへのマッピングデータを提供しています。これらのデータは、キュレータによりマニュアルキュレーションされています。MGA-searchページから、データのキーワード検索が行えます。MGA Data Overviewページからは、生物種や実験を選択したデータのブラウジングが可能です。また、FTPサイトからSGA形式データのダウンロードが行えます。さらに、「ChIP-seq」ツールやSSA サーバーを利用して様々な解析を行うことができます。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性 |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ask-epd[at]googlegroups[dot]com |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.9997ek |
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類似データベース:
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RNA Binding Protein Variant Database IRView TOHO rSNP DB2 TOHO rSNP DB BGD DBcherry autoSNPdb PigGIS JSNP（アーカイブ） WheatGenome.info |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2024-07-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |