Whole-Cell Knowledge Base: WholeCellKB
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| 運用機関名: | Karr Lab, Institute for Multiscale Biology & Genomics |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 全細胞モデルを実現するべく設計された、モデル生物データベースのオープンアクセスコレクションです。現在、グラム陽性細菌で一般的なヒト病原体であるマイコプラズマ・ジェニタリウムのデータベースが収録されています。マイコプラズマ・ジェニタリウムデータベースは、900以上の主要な研究論文、レビュー、書籍、データベースから染色体、転写ユニット、遺伝子、代謝物質、タンパク質、転写調節、反応、パスウェイなど包括的な情報を収録しています。また、BioCyc、KEGG、UniProtを含む外部のリソースと広く相互参照しています。WholeCellKB は、モデル生物データベースを構築するためのオープンソースのWebベースのソフトウェアプログラムも提供しています。WholeCellKB ソフトウェアは、個々の種を完全に記述する広範で自由にカスタマイズ可能なデータモデル（各遺伝子、タンパク質、反応、およびパスウェイ構造および機能を含む）を提供します。ウェブベースのユーザーインターフェイスや、RESTful ウェブサービスを介し、自由にアクセスできます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA, 細胞/オルガネラ, 個体/種, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.4dfs3p |
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類似データベース:
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Plant Natural Antisense Transcripts Database EVmiRNA Nuclear Receptor Signaling Atlas BloodSpot HEMM PED piRTarBase BioXpress National Microbial Pathogen Data Resource SyntDB |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |