Big Data Nucleic Acid Simulations Database: BIGNASim
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| 運用機関名: | Cataland Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), Barcelona Supercomputing Center (BSC), Barcelona University, Institute for Research in Biomedicine |
| 運用機関所在国・地域: | スペイン |
| 説明: | 核酸の構造に関する、原子論的ダイナミクスシミュレーション軌道と解析のためのデータベースです。軌道データを保存する Cassandra、および解析とメタデータの格納を行う MongoDB の 2 つの noSQL データベースエンジンを搭載しています。利用可能な軌跡に対し、一般的な解析項目（らせんパラメータ、NMR 観測値、スティフネス、水素結合、スタッキングエネルギー、および形状）を事前に計算し、NAFlex インターフェースにより提供されるインタラクティブな可視化ツールを使用して表示します。全体の軌道、軌道の断片、またはメタ軌道は、分析し、またはさらなる分析を行うためダウンロードすることができます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | DNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.k5a3yt |
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類似データベース:
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Transmembrane Helices in Genome Sequences non-B DB ProNuc BAliBASE PDBWiki MolMovDB Proteopedia Database Of Local Biomolecular Conformers DNAproDB InterEvol database |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |