NCBI Trace Archive
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| 運用機関名: | National Center for Biotechnology Information (NCBI) |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 塩基配列のデータベースです。以下のアーカイブにより構成されています： ・配列リードアーカイブ（SRA：Sequence Read Archive）：454、IonTorrent、Illumina、SOLiD、Helicos、Complete Genomicsなどの「次世代」シーケンシング技術から得られた生の配列データを保存するアーカイブです。現在は、生の配列データだけでなく、参照配列におけるリードの配置の形式でアライメント情報を保存しています。 ・Trace Archive：Applied Biosystems ABI3730 のようなゲル/キャピラリープラットフォームから得られたシーケンシングデータのリポジトリとして機能します。 ・Trace Assembly Archive：基本的なトレースデータと、GenBank に見られるような解析済みのゲノム配列をリンクさせた、配列リードのペアワイズアラインメントとマルチプルアライメントを収録しています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.abwvhp |
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類似データベース:
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TIGR Gene Indices ARCHAIC FUGU GENOME PROJECT Medaka Methylome Browser WormTSS Mouse BAC browser DDBJ/CIB ヒトゲノム情報工房 HS3D CUBE-DB OmicBrowse |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2024-07-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |