休止
(14日以上)
(14日以上)
BriX
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Flanders Institute of Biotechnology, Free University of Brussels |
| 運用機関所在国・地域: | ベルギー |
| 説明: | 主鎖骨格の類似性によりクラスタリングされたタンパク質断片のデータベースです。登録されているタンパク質断片は、Astral40のデータセットから取得した7290のタンパク質について4～14アミノ酸残基で断片化し、6種類の異なる閾値を用いて主鎖骨格の類似性によりクラスタリングを行っています。また、Loop BriXではAstral95のデータセットから取得した14.525のタンパク質からのループ断片について、両端間距離およびアンカー残基の重ね合わせによるクラスタリングを行った結果が登録されています。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 画像/動画 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PoSSuM 牛肉のプロテオーム解析データベース TMIG-2DPAGE Database SWISS-2DPAGE World-2DPAGE Repository HSG Database FUJI DB PepBase KAIKO Proteome Database Termini-Oriented Protein Function INferred Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-11-12 |
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レコード最終更新日:
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2018-08-05 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |