運用終了
TMBETA-DISC
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | アミノ酸配列をもとにβ-バレル型膜タンパク質を識別するためサポートベクターマシン (SVM)や統計的手法を用いた計算手法を開発しました。アミノ酸の構成、residue pair preference及びモチーフを主な属性とした、5種のプログラム (TMBETADISC-COMP、TMBETADISC-DIPEPTIDE、TMBETADISC-MOTIF、TMBETADISC-SVM、TMBETADISC-RBF)の利用が可能です。なお、TMBETADISC-RBFについては現在は以下のURLから公開されています。 http://rbf.bioinfo.tw/~sachen/OMPpredict/TMBETADISC-RBF.php |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 手法, 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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http://medals.jp/list/detail/162.html |
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TMBETA-GENOME （アーカイブ） CiteAb SABIO-RK Biochemical Reaction Kinetics Database Compilation and Creation of datasets from PDB antibodyregistry.org SWISS-MODEL Repository of 3D protein structure models bNAber REFOLDdb STRENDA DB WABI |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-10-29 |
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レコード最終更新日:
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2015-08-20 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |