運用終了
GTPS: Gene Trek in Prokaryote Space
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| 運用機関名: | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | ゲノム配列が決定された原核生物を対象に各種解析を行い再アノテーションを行ったデータベース。GIB (Genome Information Broker) に登録されている真正細菌と古細菌のORFを共通プロトコルを用いて再アノテーションし、グラフィカルユーザインタフェースやフラットファイルとしてデータ提供をしています。 セマンティックWeb技術によって，GTPSと微生物統合データベースにおける他の要素データベースとの連携を可能にするGTPS2011のRDF化版が http://gtps.ddbj.nig.ac.jp/rdf/ よりダウンロード可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://gtps.ddbj.nig.ac.jp/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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EnsemblBacteria GIB Burkholderia Genome DB KAOS TOT-DB Magnaporthe grisea Database EPD BGDB UTGB Metagenome.jp (Human Meta BodyMap) |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-06-25 |
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レコード最終更新日:
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2016-12-12 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |