運用終了
RIKEN Hub Database
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 理研には約400の研究室があり、それぞれが自発的に研究成果の発表を行っています。データ公開も様々な形式で行われ、現在約80のデータ提供サイトがWeb上で公開されています。このため、どこでどのようなデータが公開されているのかが分かりづらく、公開データの再利用やコンピュータを使った統合利用が容易ではありませんでした。また、ライフサイエンスで扱われるデータのほとんどは、形式が定まっていない集積困難なデータであり、塩基配列やDNAチップデータのような集積リポジトリが存在しておらず、データ公開が容易ではありません。理研総合データベースでは、SWF(Semantic Web Folders)を使うことで、理研の公開データをセマンティック・ウェブのRDF形式に準拠させつつ、さらに数百テラ～ペタバイトにもなる膨大なオミックス実験データを関連付けて、SWFからダウンロードできるように計画しています。これにより、理研が公開するデータの永続性を担保するとともに、文部科学省が推進する「ライフサイエンス統合データベース」からの統合検索を可能にし、外部からのアクセスを容易にします。本データベースは2009年3月より公開を開始しました。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PAZAR Colibri MG Workbench DeinoBase PEC PEDANT3 database Patent Data Resources SubtiList World-Wide Web Server GPIアンカー型タンパク質候補遺伝子データベース mycoCLAP |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2015-08-20 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |