PEC: Profiling of E. coli Chromosome
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | |
| URL: | |
| 運用機関名: | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 大腸菌ゲノムの全体像を明らかにするために、染色体上の全遺伝子について、特に実験的な機能解析に重要な情報を集積させる目的で構築したデータベースです。各遺伝子につき、名前、位置および向き、生育に必須か否か（文献情報を基に分類）、関連する大腸菌株の情報、既知の欠失変異株の情報、ホモロジー解析結果、ドメイン・モチーフ情報、相同遺伝子、核酸およびアミノ酸配列が掲載されています。ゲノムを欠損させた632種の株の情報も掲載されています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/pec/download.jsp |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
Colibri Escherichia coli strain K12 genome database Buruli ulcer bacillus Database SEVENS SubtiList World-Wide Web Server RAP-DB GPIアンカー型タンパク質候補遺伝子データベース DeinoBase RIKEN Hub Database PEDANT3 database |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2011-12-08 |
|
レコード最終更新日:
|
2012-10-01 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |