運用終了
NIG Mouse Genome Database
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 国立遺伝学研究所（NIG）が確立した実験マウス系統の多型情報データベースです。日本の亜種を含む4つのマウス亜種由来の10の近交系（ミシマバッテリー）について全配列ゲノム情報と単一ヌクレオチド多型および短い挿入/削除を含む可視化されたゲノム多型情報を収録しています（MSM、JF1、KJR、SWN、CHD、NJL、BGL2、HMI、BFM、PGN2）。染色体のマップビューワーによるブラウズや系統株などによる絞り込みから、個々の遺伝子について、エクソンやイントロン、アミノ酸配列の相互比較を行うことができます。また、任意の塩基配列の検索、取得も可能です。 国立遺伝学研究所によるオリジナルサイト (http://molossinus.nig.ac.jp/mog2/ ) の運用は終了し、データはMoG+ (https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc02525 ）のサイトに引き継がれています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | バイオリソース, 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://molossinus.lab.nig.ac.jp/pub/msmdb/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2018/01/research-highlights_ja/20171225.html |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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MoG (モグプラス) Knockout Mouse Project ORFeome Collaboration IMSR DGRC Gene Disruption Project Database GABI-Kat SimpleSearch Nottingham Arabidopsis Stock Centre Seeds Database RIKEN ENU-based gene-driven mutagenesis system GETDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2021-08-05 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |