運用終了
RIKEN Hub Database Project
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | タイリングアレイ（遺伝子発現情報）とゲノム情報を組み合わせて統計的に解析することにより、遺伝子の構造を高い精度で推定する新しい情報処理技術を開発しました。この技術をシロイヌナズナのデータに適用し、これまでに知られている約２万７千の遺伝子領域のほかにも、約５千２百箇所の領域で発現している新たな遺伝子構造を見出し公開しています。遺伝子のネットワークや変異体の有無に関する情報もあわせて提供しています。「Forward Genetics」、「Reverse Genetics」、「Data Integration」、「Estimation of Candidate Genes」を連携させた「統合Genetics」としてのシステムであり、また、この処理を行うために独自に開発したプログラムARTADE（アートエード）の全ソースコード（プログラム内容）も公開しています。近年のゲノミクスの発展によって、膨大な量の公開データとバイオリソースの蓄積が進行しています。これらをバイオインフォマティクスによって統合化し、より効率的な原因遺伝子探索のストラテジーを作り出すことを目的としています。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, cDNA/EST |
| タグ (データの種類): | 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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ARTADE Ecgene Transcriptome analysis of 2 component system in Eschericia coli RefExA KCGD yMGV ATTED-II RED (アーカイブ) SpBase RGP |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2020-08-10 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |