AAindex: Amino acid indices, substitution matrices and pair-wise contact potentials
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| 運用機関名: | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | アミノ酸やアミノ酸ペアの物理化学的、生化学的な様々な特性を、過去の文献データの収集とクラスター解析により数値で指標化したデータベースです。AAindex1、AAindex2、AAindex3の3つのデータベースから構成されています。 AAindex1：アミノ酸の特性を表現した20の数値セットのデータベース AAindex2：アミノ酸置換行列のデータベース AAindex3：アミノ酸間の相互作用ポテンシャルのデータベース |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://ftp.genome.jp/pub/db/community/aaindex/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://www.genome.jp/aaindex/aaindex_help.html, ftp://ftp.genome.jp/pub/db/community/aaindex/aaindex.doc |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TMFunction（アーカイブ） PMD IPI Termini-Oriented Protein Function INferred Database CASA db H-EPD InBase OWL PepBase PeptideAtlas |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2012-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |