LigandBox: LIGANds Data Base Open and eXtensible
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| 運用機関名: | 大阪大学 蛋白質研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 低分子化合物の３次元分子構造と原子荷電を提供するデータベースです。分子シュミレーションシステムmyPrestoの一部として開発され、KEGGや企業から提供された2次元の化合物データを元に、計算により3次元構造を生成しています。バーチャルスクリーニングの際のドッキング計算に使用できるようになっています。SMILES文字列やPDBにおける分子名等を利用した化学構造検索や、化合物の名称やKEGG、ChEMBL等のID、化合物の物理量による検索ができます。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | 化学物質 |
| タグ (データの種類): | 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.mypresto5.com/ligandbox/cgi-bin/lbox_download.cgi?LANG=ja |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://www.mypresto5.com/ligandbox/cgi-bin/lbox_download.cgi?LANG=ja |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/ligandbox/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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ChemSpider The UC Irvine ChemDB 3DMET Chemical Component Dictionary NLDB HATODAS（アーカイブ） SureChEMBL eCrystals Syntheses, Chemicals, and Reactions In Patents DataBase NPEdia (Natural Products Encyclopedia) 化合物検索 |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2020-03-31 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |