PDBj: Protein Data Bank Japan
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| 運用機関名: | 大阪大学 蛋白質研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 日本蛋白質構造データバンク (PDBj: Protein Data Bank Japan) は、米国の構造バイオインフォマティクス研究共同体 (RCSB)、生物学的磁気共鳴データバンク (BMRB)、および欧州バイオインフォマティクス研究所 (PDBe) と協力し、蛋白質・核酸・糖などの生体高分子の立体構造データベースを国際的なPDBアーカイブとして運営しています。また、派生する様々なデータベースやそれらの解析ツールも提供しています。 タンパク質の構造検索には、PDBML (eXtensible Markup Language：PDBの正式なXMLフォーマット) で記述したPDBデータに基づく関係データベースを使用しているPDBj Mine (http://pdbj.org/mine) がご利用になれます。詳細検索にはSQL文を指定した検索も可能です。 なお、PDBjのデータは日本時間の毎週水曜日午前９時に更新されています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | DNA, RNA, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 画像/動画, 3D構造, リポジトリ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://pdbj.org/info/archive |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://pdbj.org/#!help?PID=904 |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://pdbj.org/info/terms-conditions |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=PDBj |
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000498 |
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類似データベース:
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PDBe BMRB RCSB Protein Data Bank wwPDB JenaLib Structure MolMovDB VIPERdb Biomolecules Gallery BMRBj |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2022-05-29 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |