phosprof: Phosphorylation activity measurement-based pathway profiling database for drug-response
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 薬剤の投与により細胞内で起こるパスウェイの変化をまとめたデータベースです。産業技術総合研究所 細胞分子生物工学研究所が独自開発したタンパク質リン酸化測定および解析技術を用いて全94化合物に対して２つの細胞株で調査した結果をまとめています。タンパク質のリン酸化測定には、細胞内シグナル伝達経路を構成する1300以上の合成タンパク質を搭載したプロテインアレイを用い、全376パスウェイについてその活性を統計的に評価しています。Phosprofではリン酸化活性が特に変化した分子群をパスウェイマップ上で表示させたり、これらをもとに特徴的なパスウェイ名を調べたり、薬剤間でパスウェイ活性を比較することができます。薬剤開発や機能解析に有用です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質, 薬 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://phosprof.medals.jp/static/guide/Phosprof_UserGuide_ver1.1.pdf |
| データベースの連絡先: | https://phosprof.medals.jp/help |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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https://medals.jp/list/detail/372.html |
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Target Central Resource Database PINT DrugBank BindingDB database of measured binding affinities VARIDT DGiDB Xenobiotics Metabolism Database VnD TargetMine Therapeutically Relevant Multiple Pathways Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-10-27 |
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レコード最終更新日:
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2023-09-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |