ID: | NBDC02584 |
名称: | AlphaFold DB |
別称: | AlphaFold Protein Structure Database |
URL: | https://alphafold.ebi.ac.uk |
運用機関名: | EMBL-EBI |
運用機関所在国・地域: | イギリス |
説明: | AlphaFoldによって予測されたタンパク質の3次元構造を収録したデータベースです。各タンパク質について、UniProtから取得した基本情報とアミノ酸配列、残基ごとの信頼性メトリック(pLDDT)で色分けされたインタラクティブな3次元座標ビューワー(側鎖を含む)、タンパク質のドメイン会合や大規模トポロジーの信頼性を評価するための予測整列エラー(Predicted aligned error)を収録しています。タンパク質名、遺伝子名、UniProt ID、生物種による検索が可能です。 |
生物種: | Arabidopsis thaliana (3702), Caenorhabditis elegans (6239), Candida albicans (5476), Danio rerio (7955), Dictyostelium discoideum (44689), Drosophila melanogaster (7227), Escherichia coli (562), Glycine max (3847), Homo sapiens (9606), Leishmania infantum (5671), Methanocaldococcus jannaschii (2190), Mus musculus (10090), Mycobacterium tuberculosis (1773), Oryza sativa (4530), Plasmodium falciparum (5833), Rattus norvegicus (10116), Saccharomyces cerevisiae (4932), Schizosaccharomyces pombe (4896), Staphylococcus aureus (1280), Trypanosoma cruzi (5693), Zea mays (4577) |
タグ (対象): | タンパク質 |
タグ (データの種類): | 3D構造 |
論文等 (PubMed ID/DOI): | |
言語: | 英語 |
稼動状況: | 稼動中 |
一括ダウンロードデータへのリンク: | https://alphafold.ebi.ac.uk/download |
一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
データベースの利用許諾へのリンク: | https://alphafold.ebi.ac.uk/download |
データベースの使い方 | ― |
データベースの連絡先: | https://alphafold.ebi.ac.uk/download |
API / SPARQL endpoint: | ― |