PADS Arsenal: Prokaryotic Antiviral Defense System Arsenal
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| 運用機関名: | National Genomics Data Center, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | 原核生物の18種類の抗ウイルス防御機構に関係する遺伝子のデータベースです。30000種以上の原核生物の系統ごとに、Assembly accession、各防御機構に関係する遺伝子の数、それらのGene symbol、位置情報、転写産物のProduct accessionなどが収録されています。データは生物種名・防御機構名・Assembly accession・遺伝子名から検索可能で、その結果や、各防御機構に関係する遺伝子の情報・配列データはダウンロード可能です。また、BLAST検索や、防御機構に関係する遺伝子について、パンゲノム解析を行うこともできます。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://bigd.big.ac.cn/padsarsenal/download.php |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://bigd.big.ac.cn/padsarsenal/contact.php |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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GenomeTraFaC PRGdb GENIES Annotated regulatory Binding Sites from Orthologous Promoters Victors PlantExpress Strawberry GARDEN Aspergillus Genomes The Arabidopsis Gene Regulatory Information Server PHI-base |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2021-08-24 |
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レコード最終更新日:
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2021-08-24 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
