PLSDB
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| 運用機関名: | Saarland University |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ |
| 説明: | NCBI nucleotide database から取得したバクテリアプラスミドの配列とメタデータを整理したデータベースです。各レコードには配列長、トポロジー、分類学的情報のような種々のパラメータを付けており、これらでフィルタリングができます。 また、コンティグやロングリードのようなより長い配列についてはMashを使用することによって、遺伝子のようなより短い配列についてはBLASTnを使用することによって配列を検索することが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, cDNA/EST, DNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 書誌/ドキュメント |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://ccb-microbe.cs.uni-saarland.de/plsdb/plasmids/download/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://github.com/VGalata/plsdb/issues/ |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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pATLAS Transmembrane Helices in Genome Sequences DRAFT SEQUENCE OF FUGU GENOME ASSEMBLY RELEASE 1, 2, 3 and 4 Dfam DBTSS WebGeSTer DB - A Transcription Terminator Database ミヤコグサEST・完全長配列 TIGR Plant Transcript Assemblies Transterm Drosophila polymorphism database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-04-14 |
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レコード最終更新日:
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2020-04-14 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |