pEVE: predicted endogenous viral elements in eukaryotic genomes
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| 運用機関名: | 東海大学 医学部 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 真核生物ゲノム内に存在するウイルスゲノム様配列（endogenous viral element：EVE）の予測データベースです。GenomeSync databaseから得られた真核生物およびウィルスのゲノムの配列についてターゲットとクエリの双方としてBLASTN 検索した内因性ウイルス様配列を予測し、参考文献、塩基長、ヒットスコア、配列などを収録しています。dsDNA、dsRNA、ssDNA、ssRNA、otherの結果に分けてダウンロードが可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | DNA, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 生物分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://peve.med.u-tokai.ac.jp/data-download/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://peve.med.u-tokai.ac.jp/data-download/ |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://peve.med.u-tokai.ac.jp/faq/ |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Viral Probe Database RDP IS FINDER Telomerase Database Dfam BOLD miRBase DiProDB Transmembrane Helices in Genome Sequences Greengenes |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-03-31 |
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レコード最終更新日:
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2020-03-31 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |