Virus-Host DB
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| 運用機関名: | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | ウィルスとその宿主をNCBI taxonomy IDのペアとして整理したデータベースです。NCBI/RefSeq、またはアクセッション番号がEBI GenomesにリストされたGenBankに完全長ゲノム配列が置かれているウイルスを対象にしています。宿主情報としてはRefSeq、GenBank, UniProt、ViralZoneなどのデータベースからの情報に、文献からのマニュアルキュレーションによる情報を加えています。タキソノミー、RefSeq番号、文献情報、KEGG BRITE、ICTV、ViralZone、Plant Viruses Onlineなどのデータベースへのリンクが収録されています。ウィルス名、ウィルス系統、宿主名、宿主系統が一覧で表示され、それぞれの項目で検索できます。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://ftp.genome.jp/pub/db/virushostdb/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ftp://ftp.genome.jp/pub/db/virushostdb/ |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://www.genome.jp/virushostdb/term_of_use_japanese.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PHI-base VirHostNet 2.0 Ebola and Hemorrhagic Fever Virus Database VirusMentha Host Pathogen Interaction Database PINT PADS Arsenal リンゴ害虫生態画像データベース Victors VISDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-01-08 |
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レコード最終更新日:
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2019-01-08 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |