Omics Discovery Index: OmicsDI
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| 運用機関名: | European Molecular Biology Laboratory (EMBL), National Center for Protein Sciences |
| 運用機関所在国・地域: | 中国, European Union, イギリス |
| 説明: | 複数のレポジトリからのオミックスデータ（トランスクリプトミクス、ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクス）を統合し、検索を可能にしたリソースです。ArrayExpress、PRIDE、MassIVE、EGAなどからのメタデータと生物実体のデータをOmicsDI XML形式に変換し、PubMed、ChEBI、UniProtなどを用いてアノテーションと索引付けをすることで統合されたデータを検索することが可能です。類似のデータセットを計算して表示する機能もあります。また、APIが用意されており、プログラムからの利用も可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質, 代謝物, 化学物質, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 発現, 局在, ポータル |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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http://togotv.dbcls.jp/ja/20180704.html |
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.re1278 |
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類似データベース:
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ProteomeXchange Molecular Information Agent ProteomicsDB KOMICS MitoGenesisDB Interferome Search NCBI databases SAGD Escherichia coil Multi-omics Database Toxin and Toxin Target Database |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |
