The Department of Energy Systems Biology Knowledgebase: KBase
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| 運用機関名: | Lawrence Berkeley National Laboratory (LBNL) |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | KBase は、植物や微生物の研究において、ユーザーが自らのデータをアップロードし、共同作業者や公開データと一緒に分析し、より現実的なモデルを構築し、ワークフローと結論を共有、公開することを可能にするバイオインフォマティクスシステムです。KBaseには以下の機能があります：(1) 生物学的データの大規模分析についての検索、整理、実施、(2) 微生物ゲノムのアッセンブリとアノテーション、(3) 代謝モデルの構築と検証、(4) RNA-seqと発現データの解析、(5) 比較および系統発生の比較と解析、(6) 研究の再現性、アクセス性、再利用性を高める |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 代謝物 |
| タグ (データの種類): | 手法, 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ, リポジトリ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.jsxqrk |
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類似データベース:
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Immune Tolerance Network TrialShare MetaNetX MGnify Integrated Pathway Analysis and Visualization System HumanCyc SubtiWiki Giga Science Database Metabolomics Workbench Bioconductor YEASTNET: A consensus reconstruction of yeast metabolism |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |