Proteome-pI : proteome isoelectric point database: Proteome-pI
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| 運用機関名: | Quantitative and Computational Biology Group, Max Planck Institute for Biophysical Chemistry |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ, ポーランド |
| 説明: | 予測計算されたプロテオームにおける等電点のデータベースです。18 種類の手法を用いて計算された 5,029 件のタンパク質（2,100万の配列）の予測される等電点についてアミノ酸配列、分子量、各手法により計算された等電点の情報を収録しています。生物名や平均等電点、分子量、仮想 2D-PAGE プロット、またはアミノ酸周波数により検索･閲覧することができます。極端な pI 値を有するタンパク質も利用可能です。個々のプロテオームについて、ユーザーは、所定の手法、等電点、および分子量の範囲から求めるタンパク質を検索することができます。一般的な統計情報（タンパク質の総数、アミノ酸、平均配列長、アミノ酸およびジアミノ酸の周波数）およびUniProtKB/TrEMBL や NCBI non-redundant (nr) database などといった主要なタンパク質データベースに対応するデータセットも、あらかじめ計算されています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 画像/動画, 化学構造, 配列, 3D構造, 手法 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.yxkdpg |
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類似データベース:
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SWISS-MODEL Repository of 3D protein structure models European Hepatitis C Virus database PyDISH ProtoNet REFOLDdb ProTherm bNAber TMPad The Global Proteome Machine Database Compilation and Creation of datasets from PDB |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |