CAMPSign
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | National Institute for Research in Reproductive Health (NIRRH) |
| 運用機関所在国・地域: | インド |
| 説明: | CAMPR3 (Collection of Anti-Microbial Peptides) データベースに含まれる 45 の主要な抗菌性ペプチド (AMP) ファミリーに属する抗菌ペプチドを同定するためのツールです。ペプチドは、実験的に明らかにされている AMP のために生成されたパターンおよび HMM（隠れマルコフモデル） のようなファミリーのシグネチャーに基づいて同定されます。ユーザーは、これらの AMP シグネチャーの存在をスクリーニングするために配列を登録することができます。さらに目的の配列をBLAST にかけ、CAMP、APD、AVPdb、BACTIBASE などの一般的な AMP データベース内の相同配列を探すことができます。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 手法, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.7ynng |
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類似データベース:
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TIGRFAMs The Carbohydrate-Active enZYmes Database ProDom HAMAP database of microbial protein families PeroxiBase PROSITE PlantsT InterPro PDB-REPRDB Transporter Classification Database |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2024-01-18)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2024-07-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |