休止
(14日以上)
(14日以上)
ViBE-Z: The Virtual Brain Explorer for Zebrafish
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | |
| URL: | |
| 運用機関名: | Life Imaging Center (LIC), University of Freiburg |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ |
| 説明: | 幼生ゼブラフィッシュの脳における仮想共局在研究のためのイメージングおよび画像解析フレームワークです。現在、72 hpf（受精後経過時間）、48 hpf、および 96 hpf の幼生が利用可能です。ViBE-Z は、正確に配置された遺伝子発現パターンのデータベース（1 μm^3 の分解能）、解剖学的アトラス、およびソフトウェアを含みます。このソフトウェアは、複数の共焦点顕微鏡画像スタックを融合し、これらのデータセットを標準的幼生に配置することで、高品質なデータセットを生成します。 データはHDF5フォーマットによるダウンロードが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 発現, 局在, 画像/動画 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.xypv6g |
|
類似データベース:
|
ViBrism Database Human Protein Atlas zTRAP Melonet DB Marmoset Gene Atlas SAGD MitoGenesisDB CYCLoPs カイコ参照トランスクリプトームデータ Bgee DataBase for Gene Expression Evolution |
|
レコード管理者:
|
See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
|
レコードの由来:
|
 (2018-12-21)
|
|
レコード公開日:
|
2019-03-28 |
|
レコード最終更新日:
|
2022-09-29 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |